45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2798 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_2798  protein of unknown function DUF1611  100 
 
 
336 aa  679    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2676  hypothetical protein  92.26 
 
 
336 aa  617  1e-175  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.462333  normal  0.475395 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2903  protein of unknown function DUF1611  91.67 
 
 
336 aa  613  1e-175  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.141411 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4476  protein of unknown function DUF1611  83.93 
 
 
340 aa  578  1e-164  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4542  hypothetical protein  83.04 
 
 
340 aa  568  1e-161  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.398083  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4657  hypothetical protein  82.09 
 
 
337 aa  570  1e-161  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0034  hypothetical protein  54.68 
 
 
332 aa  385  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1770  hypothetical protein  56.02 
 
 
333 aa  384  1e-105  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0416  hypothetical protein  56.02 
 
 
333 aa  384  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2786  protein of unknown function DUF1611  55.49 
 
 
329 aa  379  1e-104  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2482  hypothetical protein  55.29 
 
 
333 aa  378  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1220  protein of unknown function DUF1611  55.15 
 
 
330 aa  379  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2557  hypothetical protein  58.73 
 
 
335 aa  364  1e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.1484  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1206  protein of unknown function DUF1611  51.82 
 
 
331 aa  363  2e-99  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.356367  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06557  hypothetical protein  52.85 
 
 
340 aa  363  2e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3166  hypothetical protein  52.87 
 
 
333 aa  359  4e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1127  hypothetical protein  54.24 
 
 
340 aa  353  2e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00160448 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3968  protein of unknown function DUF1611  52.91 
 
 
335 aa  352  2.9999999999999997e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0847793  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000678  EBNA-1 nuclear protein  52.28 
 
 
334 aa  353  2.9999999999999997e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3257  hypothetical protein  50.6 
 
 
359 aa  349  5e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.161607  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1462  hypothetical protein  53.25 
 
 
346 aa  348  8e-95  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0204992  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0366  hypothetical protein  50.45 
 
 
333 aa  348  1e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0149  protein of unknown function DUF1611  52.91 
 
 
335 aa  343  2.9999999999999997e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2789  hypothetical protein  49.39 
 
 
333 aa  335  5e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1819  hypothetical protein  48.34 
 
 
348 aa  292  7e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2779  hypothetical protein  40.43 
 
 
348 aa  168  1e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0593  protein of unknown function DUF1611  37.41 
 
 
340 aa  166  4e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0205  protein of unknown function DUF1611  34.47 
 
 
337 aa  162  6e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4403  protein of unknown function DUF1611  34.2 
 
 
343 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.654147  hitchhiker  0.000982381 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4341  protein of unknown function DUF1611  34.2 
 
 
343 aa  160  4e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1623  protein of unknown function DUF1611  39.11 
 
 
363 aa  159  6e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.631955 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1378  protein of unknown function DUF1611  39.62 
 
 
337 aa  159  9e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.421477 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2290  protein of unknown function DUF1611  37.79 
 
 
341 aa  158  1e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3589  protein of unknown function DUF1611  32.04 
 
 
348 aa  155  7e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0838311 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3511  hypothetical protein  36.18 
 
 
348 aa  155  7e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.350857 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1405  hypothetical protein  35.64 
 
 
348 aa  155  9e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2372  hypothetical protein  36.91 
 
 
349 aa  147  3e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.922484 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0852  hypothetical protein  37.18 
 
 
360 aa  147  4.0000000000000006e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.98076  normal  0.809264 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0792  hypothetical protein  31.91 
 
 
365 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0130  hypothetical protein  36.84 
 
 
338 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.550989  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0132  hypothetical protein  36.84 
 
 
338 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1538  hypothetical protein  31.74 
 
 
353 aa  127  3e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2299  hypothetical protein  31.1 
 
 
392 aa  106  6e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1935  protein of unknown function DUF1611  31.43 
 
 
354 aa  99  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.614904  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1833  hypothetical protein  28.72 
 
 
371 aa  78.6  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.531977  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>