39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1991 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_1991  putative ferredoxin-NAD reductase component  100 
 
 		 313 aa  609  1e-173  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.369486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2305  putative ferredoxin-NAD reductase component  92.65 
 
 		 313 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0479254 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2030  putative ferredoxin-NAD reductase component  92.65 
 
 		 313 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.812853 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1592  putative ferredoxin-NAD reductase component  54.97 
 
 		 315 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.581987  normal  0.0806413 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0274  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  51.3 
 
 		 321 aa  238  9e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.237193  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2336  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  50.16 
 
 		 321 aa  232  8.000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.126537  normal  0.0772192 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0136  ferredoxin  35.19 
 
 		 347 aa  178  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0780915  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2675  ferredoxin  36.28 
 
 		 352 aa  176  4e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.237463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0219  ferredoxin  37.3 
 
 		 345 aa  176  5e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.106529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2827  putative ferredoxin--NAD(+) reductase  28.25 
 
 		 419 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4333  putative ferredoxin--NAD(+) reductase  28.08 
 
 		 344 aa  98.2  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721613  normal  0.596615 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3633  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  32.28 
 
 		 341 aa  55.1  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1223  oxidoreductase  24.41 
 
 		 343 aa  53.5  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.256584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2668  oxidoreductase FAD-binding subunit  25.08 
 
 		 328 aa  53.9  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3630  multidomain oxidoreductase  26.77 
 
 		 334 aa  52.8  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42100  Ferredoxin:Oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  26.69 
 
 		 333 aa  52.4  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.416324  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2542  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  23.63 
 
 		 344 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.261713  hitchhiker  0.0000462807 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2902  oxidoreductase FAD-binding subunit  25.83 
 
 		 349 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.612031 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1442  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  23.91 
 
 		 348 aa  48.1  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.995391 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1261  ferredoxin  24.22 
 
 		 356 aa  47.8  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.842707  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0164  oxidoreductase FAD-binding subunit  27.41 
 
 		 331 aa  47  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000937839 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2434  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  28.9 
 
 		 349 aa  46.2  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.890562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3559  p-cymene monooxygenase, reductase subunit(CymAb)  24.58 
 
 		 349 aa  46.2  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.393821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2702  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  36.62 
 
 		 349 aa  45.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0792  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  30.34 
 
 		 343 aa  45.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2312  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  36.62 
 
 		 349 aa  45.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.535707  hitchhiker  0.000181189 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2192  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  34.57 
 
 		 350 aa  44.3  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.269423  normal  0.977097 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0428  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  26.23 
 
 		 338 aa  44.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504585  hitchhiker  0.000000000664459 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0252  CDP-6-deoxy-L-threo-D-glycero-4-hexulose-3- dehydrase reductase, putative  26.23 
 
 		 338 aa  44.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00410911  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0980  oxidoreductase FAD-binding region  27.27 
 
 		 327 aa  43.9  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000255596 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3299  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  29.9 
 
 		 360 aa  43.5  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.553886  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0800  oxidoreductase FAD-binding subunit  25.91 
 
 		 328 aa  43.1  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1593  putative ferredoxin NAD(+) reductase  28.57 
 
 		 332 aa  43.1  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.655318  normal  0.685768 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3790  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  30.94 
 
 		 346 aa  43.1  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5181  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  27.08 
 
 		 234 aa  42.7  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.350006  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2563  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  24.3 
 
 		 345 aa  42.7  0.008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1766  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  30.43 
 
 		 350 aa  42.7  0.008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.316393  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0492  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  29.46 
 
 		 382 aa  42.7  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.153491  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2861  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  38.03 
 
 		 351 aa  42.4  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.771556  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>