22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1792 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_1792  hypothetical protein  100 
 
 		 198 aa  403  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.393771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2176  protein of unknown function DUF447  93.4 
 
 		 198 aa  378  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.178161  normal  0.504113 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1841  hypothetical protein  93.4 
 
 		 198 aa  377  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2726  hypothetical protein  74.48 
 
 		 196 aa  289  2e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.129354 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5322  protein of unknown function DUF447  68.89 
 
 		 199 aa  254  6e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193969  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5018  hypothetical protein  70 
 
 		 198 aa  254  6e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575685 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4099  hypothetical protein  48.4 
 
 		 189 aa  176  3e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3142  hypothetical protein  48.6 
 
 		 195 aa  174  6e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3074  protein of unknown function DUF447  49.44 
 
 		 193 aa  171  5.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2393  protein of unknown function DUF447  50.57 
 
 		 185 aa  171  7.999999999999999e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2617  hypothetical protein  48.35 
 
 		 196 aa  169  3e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0409017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6498  hypothetical protein  48.6 
 
 		 201 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.760399  normal  0.0435386 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1580  hypothetical protein  48.6 
 
 		 191 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000289305  unclonable  0.000000163733 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5940  hypothetical protein  46.2 
 
 		 197 aa  160  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00846558 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1244  hypothetical protein  48 
 
 		 176 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2455  hypothetical protein  44.44 
 
 		 199 aa  148  5e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.11758  normal  0.238821 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2424  protein of unknown function DUF447  32.16 
 
 		 201 aa  84.3  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0904426  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0630  hypothetical protein  24.87 
 
 		 181 aa  49.7  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1353  hypothetical protein  23.53 
 
 		 181 aa  45.8  0.0004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1323  hypothetical protein  23.28 
 
 		 181 aa  42.7  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1332  hypothetical protein  23.53 
 
 		 187 aa  41.6  0.009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.424525  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0768  hypothetical protein  25.64 
 
 		 193 aa  41.2  0.009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>