29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1781 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_1781  protein of unknown function DUF201  100 
 
 		 378 aa  731    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2165  protein of unknown function DUF201  85.98 
 
 		 412 aa  607  1e-173  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.111476  normal  0.292956 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1830  hypothetical protein  84.76 
 
 		 374 aa  585  1e-166  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0529  hypothetical protein  59.66 
 
 		 383 aa  351  1e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.865986 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6003  protein of unknown function DUF201  58.91 
 
 		 376 aa  339  5e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.866607  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5779  hypothetical protein  52.16 
 
 		 384 aa  295  1e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0168364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2386  protein of unknown function DUF201  40.58 
 
 		 381 aa  196  7e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3534  hypothetical protein  39.89 
 
 		 391 aa  196  7e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.72291 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1659  hypothetical protein  33.33 
 
 		 354 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.256819  normal  0.444616 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3083  protein of unknown function DUF201  34.88 
 
 		 380 aa  144  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0260  hypothetical protein  31.46 
 
 		 403 aa  137  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5947  hypothetical protein  33.92 
 
 		 393 aa  135  9e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0095496 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2608  hypothetical protein  34.63 
 
 		 386 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0133551  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2862  hypothetical protein  32.28 
 
 		 380 aa  126  8.000000000000001e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2432  hypothetical protein  31.99 
 
 		 402 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6483  hypothetical protein  31.71 
 
 		 407 aa  113  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.422069 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3151  hypothetical protein  31.22 
 
 		 415 aa  100  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1666  hypothetical protein  26.03 
 
 		 355 aa  57.8  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1641  hypothetical protein  28.42 
 
 		 299 aa  53.5  0.000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1043  hypothetical protein  22.84 
 
 		 302 aa  50.4  0.00005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1440  hypothetical protein  23.64 
 
 		 302 aa  50.4  0.00006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.357308  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2798  hypothetical protein  28.72 
 
 		 366 aa  50.1  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.105487 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0329  hypothetical protein  23.81 
 
 		 302 aa  49.7  0.00009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1583  hypothetical protein  22.97 
 
 		 302 aa  49.7  0.00009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1917  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.43 
 
 		 1065 aa  47.4  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0662  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  22.46 
 
 		 1072 aa  45.1  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4917  D-alanine/D-alanine ligase  29.66 
 
 		 309 aa  44.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.912808  normal  0.0828736 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1541  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  21.55 
 
 		 1077 aa  44.7  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0371  hypothetical protein  22.17 
 
 		 290 aa  43.1  0.008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000731332  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>