17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1313 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3740  cellulose synthase subunit B  67.54 
 
 		 842 aa  1027    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1568  cellulose synthase subunit B  87.79 
 
 		 880 aa  1333    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.113014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1368  hypothetical protein  86.55 
 
 		 881 aa  1342    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0776152  normal  0.0920339 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0274  hypothetical protein  62.56 
 
 		 862 aa  972    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.237826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1313  hypothetical protein  100 
 
 		 875 aa  1701    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.240871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0106  hypothetical protein  43.59 
 
 		 858 aa  542  1e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00890818  normal  0.867993 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4804  cellulose synthase subunit B  39.91 
 
 		 843 aa  538  1e-151  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.328692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4798  hypothetical protein  41.25 
 
 		 766 aa  300  7e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.205372 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1205  cellulose synthase subunit B  28.3 
 
 		 817 aa  231  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.625186  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1294  cellulose synthase subunit B  31.61 
 
 		 813 aa  201  5e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5209  cellulose synthase subunit B  30.17 
 
 		 773 aa  189  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.656767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5534  celB protein  27.04 
 
 		 758 aa  178  4e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00788  celB protein  24.57 
 
 		 758 aa  100  8e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0963  hypothetical protein  28.07 
 
 		 721 aa  97.8  7e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.355917 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0332  cellulose synthase  26.37 
 
 		 725 aa  89  4e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1977  putative cellulose synthase  26.14 
 
 		 725 aa  84.3  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.94511  normal  0.202937 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4174  putative PAS/PAC sensor protein  26.87 
 
 		 727 aa  78.6  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>