26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2817 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2817  HupK protein  100 
 
 		 388 aa  751    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1965  hypothetical protein  51.29 
 
 		 390 aa  343  2.9999999999999997e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.241509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1287  hypothetical protein  44.06 
 
 		 384 aa  211  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.272363  normal  0.489405 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4118  putative hydrogenase expression/formation protein HupK  37.08 
 
 		 391 aa  158  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2497  Ni,Fe-hydrogenase I large subunit  28.41 
 
 		 379 aa  84.7  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.633578  normal  0.13514 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4563  hypothetical protein  31.68 
 
 		 368 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1164  hydrogenase expression/formation  37.2 
 
 		 369 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0669591  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2005  hydrogenase expression/formation  30.96 
 
 		 368 aa  72  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.432728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1172  coenzyme F420-reducing hydrogenase alpha subunit-like  37.37 
 
 		 370 aa  70.9  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.903456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3763  putative hydrogenase expression/formation protein HupK  37.78 
 
 		 373 aa  67  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7257  HupK protein  29.86 
 
 		 336 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.53403  normal  0.383588 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2181  putative hydrogenase expression/formation protein HupK  43.33 
 
 		 329 aa  60.8  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.124929  normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1167  putative hydrogenase expression/formation protein HupK  40 
 
 		 406 aa  58.2  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.819635  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2020  hypothetical protein  40.48 
 
 		 379 aa  53.1  0.000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0920  coenzyme F420-reducing hydrogenase alpha subunit-like protein  29.94 
 
 		 379 aa  52.4  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50500  hydrogenase expression/formation protein HoxV  39.77 
 
 		 348 aa  50.1  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.102569  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1158  putative hydrogenase expression/formation protein HupK  32.93 
 
 		 329 aa  47.8  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.846378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1147  nickel-dependent hydrogenase large subunit  32.54 
 
 		 488 aa  47.8  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3095  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  31.91 
 
 		 477 aa  47.4  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0493  hydrogenase large subunit  32.52 
 
 		 475 aa  45.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0342  nickel-dependent hydrogenase large subunit  32.8 
 
 		 485 aa  44.7  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0846503  normal  0.979503 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3980  hypothetical protein  34.12 
 
 		 308 aa  44.3  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0441  hypothetical protein  27.12 
 
 		 397 aa  43.9  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2144  hydrogen:quinone oxidoreductase  31.71 
 
 		 475 aa  43.1  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.883688  normal  0.196706 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2155  HupK  34.23 
 
 		 270 aa  42.7  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.127907 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0080  nickel-dependent hydrogenase large subunit  22.25 
 
 		 421 aa  42.7  0.01  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.303597  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>