39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1698 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1698  hypothetical protein  100 
 
 		 206 aa  392  1e-108  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.203983  normal  0.249154 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1571  hypothetical protein  39.35 
 
 		 249 aa  69.7  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0611813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3857  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  32.91 
 
 		 199 aa  60.8  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3164  hypothetical protein  33.33 
 
 		 240 aa  59.7  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2511  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  33.33 
 
 		 240 aa  58.9  0.00000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3427  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  31.47 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0534408  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3777  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  30.32 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3955  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  30.32 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3632  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  30.32 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5056  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  36 
 
 		 225 aa  58.2  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3584  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  31.47 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000456078  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02289  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  32.79 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.104095 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0782  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  31.29 
 
 		 221 aa  57  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0196066  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4797  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  31.25 
 
 		 220 aa  57  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4677  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  31.25 
 
 		 220 aa  57  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0601381  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4817  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  31.25 
 
 		 220 aa  57  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.452254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4762  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  31.25 
 
 		 220 aa  57  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4667  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  31.25 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.651941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3025  hypothetical protein  35.14 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0600  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  34.21 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000823613 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4688  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  30.82 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.041656  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04081  predicted regulator of cell morphogenesis and cell wall metabolism  30.14 
 
 		 220 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00617951  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2399  hypothetical protein  34.03 
 
 		 224 aa  54.3  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0283392  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3784  protein of unknown function DUF542 ScdA domain protein  30.14 
 
 		 220 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0015085  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04044  hypothetical protein  30.14 
 
 		 220 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00616403  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4750  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  30.14 
 
 		 220 aa  54.3  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.020864  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3797  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  30.14 
 
 		 220 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000715657  normal  0.850161 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4777  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  30.14 
 
 		 220 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00129664  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4463  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  30.14 
 
 		 220 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00510158  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4655  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  32.89 
 
 		 223 aa  53.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.84876  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3578  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  32.89 
 
 		 223 aa  53.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.670531 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0574  hypothetical protein  25.32 
 
 		 213 aa  53.1  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.157203 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0815  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  31.88 
 
 		 222 aa  52.8  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0339092  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1841  hypothetical protein  31.72 
 
 		 242 aa  52.8  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5726  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  30.14 
 
 		 220 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0664368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4224  hypothetical protein  31.47 
 
 		 226 aa  51.2  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0379  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  31.25 
 
 		 220 aa  51.2  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000130602  normal  0.725738 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2304  putative regulator of cell morphogenesis and NO signaling  30.92 
 
 		 162 aa  49.7  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.904148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03871  regulator of cell morphogenesis and NO signaling  30.38 
 
 		 229 aa  48.5  0.00007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>