38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2712 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2712  dihydropteroate synthase DHPS  100 
 
 		 471 aa  934    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2402  dihydropteroate synthase  63.42 
 
 		 471 aa  569  1e-161  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2299  dihydropteroate synthase-related protein  64.63 
 
 		 474 aa  549  1e-155  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0215  dihydropteroate synthase-related protein  61.57 
 
 		 470 aa  519  1e-146  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1673  hypothetical protein  54.32 
 
 		 475 aa  478  1e-133  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.293824  hitchhiker  0.0000000161519 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0306  dihydropteroate synthase  43.97 
 
 		 489 aa  347  3e-94  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0190  hypothetical protein  40.88 
 
 		 493 aa  324  2e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0717  dihydropteroate synthase-related protein  41.49 
 
 		 482 aa  271  1e-71  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0827  dihydropteroate synthase-related protein  29.24 
 
 		 523 aa  207  5e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.376775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1090  dihydropteroate synthase-related protein  28.82 
 
 		 523 aa  203  7e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0516227  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0605  dihydropteroate synthase-related protein  28.71 
 
 		 530 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1829  dihydropteroate synthase-related protein  28.46 
 
 		 523 aa  199  7e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0892  dihydropteroate synthase-related protein  27.69 
 
 		 523 aa  194  3e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0631  dihydropteroate synthase-related protein  31.25 
 
 		 512 aa  135  1.9999999999999998e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.498786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5017  dihydropteroate synthase DHPS  30.95 
 
 		 471 aa  125  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00770286 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1842  dihydropteroate synthase DHPS  30.37 
 
 		 524 aa  124  4e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0222  dihydropteroate synthase-related protein  28.6 
 
 		 498 aa  123  6e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.70107  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2177  dihydropteroate synthase DHPS  30.14 
 
 		 524 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.339932  normal  0.330618 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1793  dihydropteroate synthase DHPS  29.67 
 
 		 524 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.425163  normal  0.963011 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5321  dihydropteroate synthase DHPS  29.82 
 
 		 471 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2725  dihydropteroate synthase DHPS  29.56 
 
 		 520 aa  113  6e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.63462  normal  0.0704313 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2035  dihydropteroate synthase DHPS  26.55 
 
 		 489 aa  111  2.0000000000000002e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00317659  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1245  pterin-binding domain-containing protein  28.63 
 
 		 465 aa  111  3e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4100  dihydropteroate synthase DHPS  29.06 
 
 		 472 aa  110  4.0000000000000004e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5941  dihydropteroate synthase DHPS  27.85 
 
 		 461 aa  108  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0197789 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2616  pterin-binding domain-containing protein  29.22 
 
 		 479 aa  107  4e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.521784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2441  tetrahydromethanopterin biosynthesis protein  28.22 
 
 		 460 aa  106  7e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3143  dihydropteroate synthase DHPS  26.74 
 
 		 471 aa  102  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2394  dihydropteroate synthase DHPS  28.63 
 
 		 464 aa  101  3e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1581  dihydropteroate synthase, DHPS  26.77 
 
 		 481 aa  101  3e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00143208  unclonable  0.000000236622 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3075  dihydropteroate synthase DHPS  27.19 
 
 		 495 aa  101  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6492  dihydropteroate synthase DHPS  25.29 
 
 		 462 aa  95.1  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.137356 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0815  thymidylate synthase  41.11 
 
 		 508 aa  57.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.148226 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5011  thymidylate synthase  40.51 
 
 		 497 aa  51.2  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2280  tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit A  52.5 
 
 		 380 aa  47.4  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.882488 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1276  thymidylate synthase  37.5 
 
 		 508 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0565083 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1245  thymidylate synthase  34.18 
 
 		 497 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0726  thymidylate synthase  32.53 
 
 		 512 aa  43.9  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>