33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2082 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_2082  diphthamide biosynthesis protein  100 
 
 
315 aa  635    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.829732 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1846  diphthamide biosynthesis protein  62.9 
 
 
315 aa  409  1e-113  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2168  diphthamide biosynthesis protein  62.18 
 
 
317 aa  394  1e-108  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.614157  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0218  hypothetical protein  55.24 
 
 
316 aa  355  6.999999999999999e-97  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2613  diphthamide biosynthesis protein  59.52 
 
 
295 aa  347  1e-94  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1634  diphthamide synthase subunit  43.17 
 
 
335 aa  256  4e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1635  diphthamide biosynthesis protein  44.01 
 
 
334 aa  250  3e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1436  diphthamide biosynthesis protein  41.19 
 
 
331 aa  246  4e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2799  diphthamide biosynthesis protein  38.1 
 
 
349 aa  228  9e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.815597  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2492  diphthamide biosynthesis protein  36.31 
 
 
348 aa  226  4e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1803  diphthamide biosynthesis protein  35.46 
 
 
349 aa  226  5.0000000000000005e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0813  diphthamide biosynthesis protein  35.67 
 
 
347 aa  220  3e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.528127 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3588  diphthamide biosynthesis protein  35.46 
 
 
353 aa  219  3.9999999999999997e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0484  diphthamide biosynthesis protein  33.02 
 
 
325 aa  188  9e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1270  diphthamide biosynthesis protein  33.23 
 
 
333 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1864  diphthamide biosynthesis protein  34.04 
 
 
332 aa  162  6e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.866923 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0882  diphthamide biosynthesis protein  35.53 
 
 
340 aa  149  6e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0905  diphthamide biosynthesis protein  26.84 
 
 
331 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1563  diphthamide biosynthesis protein  28.62 
 
 
331 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0764  diphthamide biosynthesis protein  27.71 
 
 
309 aa  106  4e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1187  diphthamide biosynthesis protein  26.51 
 
 
309 aa  104  1e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.20081  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1190  diphthamide biosynthesis protein  25.07 
 
 
309 aa  102  6e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1488  diphthamide biosynthesis protein  26.51 
 
 
309 aa  102  7e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20589  predicted protein  30.77 
 
 
434 aa  95.1  1e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43090  predicted protein  30.79 
 
 
452 aa  90.1  4e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0109024  normal  0.0260674 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35812  predicted protein  26.38 
 
 
421 aa  81.6  0.00000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0979008 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1360  hypothetical protein  29.05 
 
 
303 aa  73.2  0.000000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00886743 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0393  diphthamide biosynthesis protein  26.71 
 
 
303 aa  69.3  0.00000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0784701 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1114  diphthamide biosynthesis protein  31.78 
 
 
302 aa  67.4  0.0000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1734  hypothetical protein  26.3 
 
 
303 aa  63.2  0.000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00147027 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1133  diphthamide biosynthesis protein  31.36 
 
 
337 aa  59.3  0.00000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.45882 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07400  cytoplasm protein, putative  22.95 
 
 
529 aa  47.8  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.185161  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM02230  peptidyl-diphthamide biosynthesis, putative  28.7 
 
 
515 aa  45.1  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>