28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8498 on replicon NC_011892
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011892  Mnod_8498  hypothetical protein  100 
 
 
102 aa  199  7e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8620  hypothetical protein  78.33 
 
 
181 aa  87  7e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6884  hypothetical protein  63.1 
 
 
181 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8431  hypothetical protein  81.67 
 
 
181 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5622  Transposase and inactivated derivatives-like protein  47.25 
 
 
353 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.486566  normal  0.318804 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5479  Transposase and inactivated derivatives-like protein  47.25 
 
 
353 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.624312 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6134  hypothetical protein  70 
 
 
167 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2837  hypothetical protein  42.7 
 
 
187 aa  62.8  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1175  hypothetical protein  38.78 
 
 
182 aa  57.8  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4058  transposase and inactivated derivative  41.98 
 
 
169 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.407481  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2042  transposase and inactivated derivative  44.71 
 
 
169 aa  53.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.964453  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3062  hypothetical protein  38.71 
 
 
181 aa  53.5  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.823663  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2729  transposase IS630  46.67 
 
 
352 aa  50.4  0.000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.379851  normal  0.536642 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0201  transposase IS630  46.67 
 
 
352 aa  50.4  0.000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.213338  normal  0.356281 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0343  transposase IS630  46.67 
 
 
352 aa  50.4  0.000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0464897  normal  0.0200059 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3356  transposase  46.67 
 
 
352 aa  50.4  0.000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.00274961  normal  0.454158 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2735  transposase IS630  46.67 
 
 
352 aa  50.4  0.000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0929513 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0652  transposase IS630  46.67 
 
 
352 aa  50.4  0.000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2596  transposase IS630  46.67 
 
 
352 aa  50.4  0.000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.551106  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2362  transposase IS630  46.67 
 
 
352 aa  50.4  0.000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1731  transposase  46.67 
 
 
352 aa  50.4  0.000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1725  transposase  46.67 
 
 
352 aa  50.4  0.000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1722  transposase IS630  46.67 
 
 
352 aa  50.4  0.000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.573415  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1716  transposase IS630  46.67 
 
 
352 aa  50.4  0.000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0934  transposase IS630  46.67 
 
 
352 aa  50.4  0.000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.32183 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0932  transposase IS630  46.67 
 
 
352 aa  50.4  0.000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.413618 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2738  transposase IS630  46.67 
 
 
352 aa  50.4  0.000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.261651  normal  0.0929513 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3611  hypothetical protein  50.67 
 
 
96 aa  44.3  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.159699  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>