23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7376 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_7376  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 246 aa  470  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6630  NUDIX hydrolase  78.05 
 
 		 245 aa  305  6e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.707478  normal  0.113041 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2288  NUDIX hydrolase  52.5 
 
 		 456 aa  194  1e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.514522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1524  NUDIX hydrolase  49.17 
 
 		 260 aa  187  2e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.691328  normal  0.577516 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1804  NUDIX hydrolase  47.92 
 
 		 260 aa  181  1e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.807933  normal  0.0812819 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1525  NUDIX hydrolase  48.33 
 
 		 441 aa  180  2e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.103483 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1073  hypothetical protein  46.22 
 
 		 240 aa  175  6e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1729  hypothetical protein  42.68 
 
 		 253 aa  151  8e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.754048 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0592  hypothetical protein  31.62 
 
 		 241 aa  119  3e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.323051  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4094  hypothetical protein  39.32 
 
 		 245 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0074  hypothetical protein  30.54 
 
 		 256 aa  94.4  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1506  NUDIX hydrolase  27.73 
 
 		 390 aa  88.6  9e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27390  hypothetical protein  34.33 
 
 		 247 aa  87.4  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0368828  normal  0.805501 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1796  hypothetical protein  36.21 
 
 		 252 aa  82.8  0.000000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.322424  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1833  hypothetical protein  36.78 
 
 		 252 aa  82.8  0.000000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0714167  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1550  Protein of unknown function DUF2210  39.27 
 
 		 223 aa  80.9  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0426394  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5481  hypothetical protein  37.55 
 
 		 222 aa  76.3  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0260  hypothetical protein  33.92 
 
 		 169 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.764522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1709  hypothetical protein  33.67 
 
 		 227 aa  66.6  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2399  hypothetical protein  33.59 
 
 		 243 aa  64.3  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.699479 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3523  hypothetical protein  36.21 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.1598  normal  0.79365 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0646  hypothetical protein  33.59 
 
 		 249 aa  54.3  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3994  hypothetical protein  45.12 
 
 		 86 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>