32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3358 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3358    100 
 
 		 1046 bp  2074    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6392  putative transposase  87.93 
 
 		 1080 bp  341  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4694  hypothetical protein  84.56 
 
 		 1014 bp  103  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5589  putative transposase  85.25 
 
 		 1122 bp  99.6  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6444    85.58 
 
 		 507 bp  87.7  0.000000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8357  putative transposase  86.21 
 
 		 1071 bp  77.8  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5437  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  82.5 
 
 		 903 bp  71.9  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0513  transposase  80.99 
 
 		 864 bp  67.9  0.000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0493    80.99 
 
 		 1077 bp  67.9  0.000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4619    90.38 
 
 		 549 bp  63.9  0.00000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.483735  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3895  putative transposase  90.38 
 
 		 1095 bp  63.9  0.00000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1627  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  80.6 
 
 		 1095 bp  60  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.857039  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4085  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  80.6 
 
 		 1095 bp  60  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.508946  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4262  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  80.6 
 
 		 1095 bp  60  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.234928  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3168  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  80.6 
 
 		 1095 bp  60  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.555187  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2834  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  80.6 
 
 		 1095 bp  60  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.996081  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2516  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  80.6 
 
 		 1095 bp  60  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2447  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  80.6 
 
 		 1095 bp  60  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.32  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1628  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  80.6 
 
 		 1095 bp  60  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.32  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0871  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  80.6 
 
 		 1095 bp  60  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5423  putative transposase  96.97 
 
 		 1101 bp  58  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.365485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2853    86.67 
 
 		 507 bp  56  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0765    90.91 
 
 		 1113 bp  56  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.655086  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3888    88.89 
 
 		 565 bp  52  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.599643  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4423  putative transposase  87.04 
 
 		 1092 bp  52  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0109632 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4635  putative transposase  87.04 
 
 		 1092 bp  52  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.698522 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5839  putative transposase  87.04 
 
 		 1092 bp  52  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0543  hypothetical protein  96.43 
 
 		 297 bp  48.1  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00651  isrso5-transposase protein  93.75 
 
 		 729 bp  48.1  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0330214  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3014  hypothetical protein  88.64 
 
 		 936 bp  48.1  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8042  transcriptional regulator AraC family  93.75 
 
 		 753 bp  48.1  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3532  ISMsm5, transposase  91.67 
 
 		 1113 bp  48.1  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0556834  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>