31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2193 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2193  protein of unknown function DUF1127  100 
 
 		 50 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2496  hypothetical protein  84 
 
 		 120 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.175447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1572  hypothetical protein  68.29 
 
 		 48 aa  62  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.713937  normal  0.572982 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1791  hypothetical protein  58.54 
 
 		 46 aa  52  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.601351  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0895  hypothetical protein  61.54 
 
 		 48 aa  51.6  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0744293  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0891  hypothetical protein  61.54 
 
 		 48 aa  51.6  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2332  hypothetical protein  55.56 
 
 		 48 aa  51.6  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0728  hypothetical protein  61.7 
 
 		 52 aa  50.8  0.000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3291  hypothetical protein  54.35 
 
 		 51 aa  50.4  0.000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0682  hypothetical protein  61.7 
 
 		 52 aa  50.8  0.000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3865  hypothetical protein  61.7 
 
 		 48 aa  50.4  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5370  hypothetical protein  51.22 
 
 		 48 aa  49.7  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.157659 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6602  protein of unknown function DUF1127  56.41 
 
 		 48 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000878075 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5661  protein of unknown function DUF1127  56.41 
 
 		 48 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.647025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1180  hypothetical protein  57.14 
 
 		 66 aa  47.8  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.278308  normal  0.0615222 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3375  hypothetical protein  51.28 
 
 		 48 aa  47.4  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6084  protein of unknown function DUF1127  53.85 
 
 		 48 aa  47  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3167  protein of unknown function DUF1127  50 
 
 		 50 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.170768  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2481  hypothetical protein  52.27 
 
 		 49 aa  46.6  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.123002  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2771  hypothetical protein  50 
 
 		 50 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.167361 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1502  protein of unknown function DUF1127  53.85 
 
 		 48 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5587  hypothetical protein  48.78 
 
 		 48 aa  45.1  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.512418  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2727  hypothetical protein  45.83 
 
 		 50 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.172753  normal  0.226683 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2772  hypothetical protein  45.83 
 
 		 50 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.559182  normal  0.91457 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1700  protein of unknown function DUF1127  51.43 
 
 		 48 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.966723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1179  hypothetical protein  51.43 
 
 		 47 aa  42.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.175131  normal  0.0358301 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1501  protein of unknown function DUF1127  54.29 
 
 		 47 aa  41.6  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.941747 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1699  protein of unknown function DUF1127  54.29 
 
 		 47 aa  41.6  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.745671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0418  hypothetical protein  51.35 
 
 		 75 aa  41.6  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4397  hypothetical protein  46.15 
 
 		 43 aa  41.2  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0221753 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0623  hypothetical protein  47.73 
 
 		 64 aa  40.4  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.16233 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>