17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0360 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_0360  hypothetical protein  100 
 
 
248 aa  494  1e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0934561  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6091  hypothetical protein  35.81 
 
 
256 aa  160  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.241137  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3644  hypothetical protein  34.52 
 
 
250 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3593  hypothetical protein  43.26 
 
 
255 aa  102  5e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3073  hypothetical protein  29.78 
 
 
270 aa  84  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0765058  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0651  hypothetical protein  26.24 
 
 
281 aa  64.3  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.577718 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5404  hypothetical protein  34.83 
 
 
192 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5457  hypothetical protein  34.83 
 
 
192 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.325137 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4176  hypothetical protein  25.75 
 
 
282 aa  60.1  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.229359  normal  0.0939497 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3323  hypothetical protein  36.36 
 
 
208 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.121865 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4812  hypothetical protein  35.63 
 
 
192 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.474729  normal  0.831292 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5342  hypothetical protein  33.67 
 
 
192 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.317279  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4800  hypothetical protein  33.67 
 
 
192 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0194  hypothetical protein  34.69 
 
 
192 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.612383  normal  0.642506 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0928  hypothetical protein  29.2 
 
 
236 aa  58.2  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00224597  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0211  hypothetical protein  36.08 
 
 
193 aa  56.6  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.449964 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1511  hypothetical protein  30.14 
 
 
282 aa  45.8  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0038904  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>