12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0211 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0211  hypothetical protein  100 
 
 		 193 aa  392  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.449964 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3323  hypothetical protein  65.1 
 
 		 208 aa  265  2.9999999999999995e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.121865 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5342  hypothetical protein  62.5 
 
 		 192 aa  259  2e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.317279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4800  hypothetical protein  61.46 
 
 		 192 aa  256  1e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0194  hypothetical protein  68.54 
 
 		 192 aa  254  6e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.612383  normal  0.642506 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5404  hypothetical protein  63.69 
 
 		 192 aa  251  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5457  hypothetical protein  63.69 
 
 		 192 aa  251  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.325137 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4812  hypothetical protein  64.25 
 
 		 192 aa  238  5e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.474729  normal  0.831292 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6091  hypothetical protein  34.26 
 
 		 256 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.241137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0360  hypothetical protein  36.08 
 
 		 248 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0934561  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3593  hypothetical protein  28.26 
 
 		 255 aa  48.5  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3644  hypothetical protein  24.82 
 
 		 250 aa  46.6  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>