13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_5457 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008061  Bcen_5404  hypothetical protein  100 
 
 
192 aa  383  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5457  hypothetical protein  100 
 
 
192 aa  383  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.325137 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4812  hypothetical protein  98.44 
 
 
192 aa  377  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.474729  normal  0.831292 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4800  hypothetical protein  88.02 
 
 
192 aa  344  4e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5342  hypothetical protein  87.5 
 
 
192 aa  341  5e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.317279  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0194  hypothetical protein  90.62 
 
 
192 aa  340  5.999999999999999e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.612383  normal  0.642506 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3323  hypothetical protein  76.04 
 
 
208 aa  297  7e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.121865 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0211  hypothetical protein  63.69 
 
 
193 aa  251  4.0000000000000004e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.449964 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0360  hypothetical protein  34.83 
 
 
248 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0934561  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3593  hypothetical protein  30.37 
 
 
255 aa  57.8  0.00000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6091  hypothetical protein  30.7 
 
 
256 aa  55.1  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.241137  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3644  hypothetical protein  30.68 
 
 
250 aa  51.2  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3073  hypothetical protein  25.31 
 
 
270 aa  43.5  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0765058  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>