34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_4069 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_4069  hypothetical protein  100 
 
 
171 aa  340  7e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1834  hypothetical protein  34.83 
 
 
177 aa  83.6  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0955  hypothetical protein  31.29 
 
 
169 aa  75.1  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1115  hypothetical protein  32.52 
 
 
167 aa  74.7  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4742  hypothetical protein  35.07 
 
 
163 aa  74.3  0.0000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.593636  normal  0.13077 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0125  hypothetical protein  34.15 
 
 
177 aa  72.4  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2465  hypothetical protein  33.12 
 
 
185 aa  70.5  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2330  hypothetical protein  35.58 
 
 
171 aa  67.4  0.00000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.100797  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2771  hypothetical protein  33.77 
 
 
170 aa  67  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.403966  normal  0.41413 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1372  hypothetical protein  28.48 
 
 
169 aa  67.4  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1065  hypothetical protein  32.05 
 
 
174 aa  63.9  0.0000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01680  hypothetical protein  30.77 
 
 
176 aa  63.9  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3176  hypothetical protein  34.21 
 
 
162 aa  62  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.148623  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3378  hypothetical protein  32.3 
 
 
190 aa  58.9  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1315  hypothetical protein  29.65 
 
 
193 aa  58.2  0.00000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.749821  normal  0.330584 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3048  hypothetical protein  31.4 
 
 
193 aa  58.2  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3205  hypothetical protein  31.4 
 
 
193 aa  58.2  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.824686 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0459  hypothetical protein  35.56 
 
 
160 aa  57  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3062  hypothetical protein  32.8 
 
 
193 aa  56.6  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2435  hypothetical protein  28.93 
 
 
186 aa  55.5  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0871  membrane protein  30.07 
 
 
177 aa  54.3  0.0000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.607811  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1171  hypothetical protein  34.32 
 
 
181 aa  53.9  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.101943  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1242  hypothetical protein  29.76 
 
 
181 aa  53.1  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.976813  normal  0.827969 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5848  hypothetical protein  29.27 
 
 
216 aa  53.1  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6579  hypothetical protein  30 
 
 
195 aa  52.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1172  hypothetical protein  28.92 
 
 
181 aa  50.8  0.000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2708  hypothetical protein  27.63 
 
 
217 aa  50.1  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.240374  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1488  hypothetical protein  29.3 
 
 
174 aa  48.9  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3030  hypothetical protein  28.31 
 
 
196 aa  48.9  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0565079  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01819  hypothetical protein  27.63 
 
 
171 aa  47.8  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3020  hypothetical protein  27.92 
 
 
162 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.428911  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01776  hypothetical protein  26.58 
 
 
181 aa  42.7  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.149803  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003860  hypothetical protein  39.47 
 
 
124 aa  42  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1953  hypothetical protein  23.53 
 
 
186 aa  41.2  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0614302 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>