29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_1487 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1487  hypothetical protein  100 
 
 
114 aa  231  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1509  hypothetical protein  100 
 
 
114 aa  231  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.322803  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1485  hypothetical protein  92.04 
 
 
121 aa  214  2e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0372  hypothetical protein  59.65 
 
 
122 aa  148  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0110151 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2958  hypothetical protein  56.14 
 
 
122 aa  140  8e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.702882  normal  0.292777 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0160  hypothetical protein  34.48 
 
 
120 aa  80.5  0.000000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2480  hypothetical protein  66 
 
 
58 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1109  hypothetical protein  30.7 
 
 
122 aa  66.6  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.705839 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5736  hypothetical protein  31.9 
 
 
130 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.853657  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2630  hypothetical protein  30.43 
 
 
122 aa  57.4  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.389405  normal  0.640654 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2519  hypothetical protein  25.86 
 
 
120 aa  53.9  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.063986  normal  0.852215 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2220  hypothetical protein  29.91 
 
 
124 aa  53.5  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00202987  normal  0.0726864 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4166  hypothetical protein  30 
 
 
126 aa  53.1  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.25145  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2063  hypothetical protein  31.78 
 
 
121 aa  52.4  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2602  hypothetical protein  34.58 
 
 
127 aa  52.8  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0738008  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1248  hypothetical protein  24.35 
 
 
122 aa  49.7  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0238294  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2331  hypothetical protein  28.18 
 
 
125 aa  50.1  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0045  hypothetical protein  30.36 
 
 
124 aa  47.4  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000429273 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0839  hypothetical protein  26.55 
 
 
120 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00360004 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2890  hypothetical protein  31.19 
 
 
126 aa  46.6  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1781  UspA domain-containing protein  30.63 
 
 
285 aa  46.6  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1472  hypothetical protein  27.12 
 
 
265 aa  45.8  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1774  hypothetical protein  27.52 
 
 
120 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1811  hypothetical protein  27.52 
 
 
120 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.937461 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2511  hypothetical protein  27.52 
 
 
120 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1638  hypothetical protein  30.19 
 
 
127 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0416797 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1767  hypothetical protein  26.61 
 
 
120 aa  44.3  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.144768  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1630  hypothetical protein  30.19 
 
 
127 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.634363  normal  0.124961 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1563  hypothetical protein  30.19 
 
 
127 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>