47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0844 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008705  Mkms_1753  integrase catalytic subunit  92.18 
 
 		 753 bp  793    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.344033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4752  integrase catalytic subunit  92.18 
 
 		 1038 bp  793    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4204  integrase catalytic subunit  92.18 
 
 		 1038 bp  793    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.250601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3188  integrase catalytic subunit  92.18 
 
 		 1038 bp  793    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.524164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4452  integrase catalytic subunit  92.18 
 
 		 753 bp  793    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2264  integrase catalytic subunit  92.18 
 
 		 753 bp  793    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.577576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1664  integrase catalytic subunit  92.18 
 
 		 753 bp  793    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.183363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1590  integrase catalytic subunit  92.18 
 
 		 753 bp  793    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4763  integrase catalytic subunit  92.18 
 
 		 1038 bp  793    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1111  integrase catalytic subunit  93.37 
 
 		 822 bp  848    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.461857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0584    93.6 
 
 		 573 bp  799    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0274805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2639    92.18 
 
 		 1139 bp  793    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0508938  normal  0.888371 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1737  integrase catalytic subunit  92.18 
 
 		 753 bp  793    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.524311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1474  integrase catalytic subunit  92.18 
 
 		 753 bp  793    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5362  integrase catalytic subunit  91.84 
 
 		 753 bp  777    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.958298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0844    100 
 
 		 626 bp  1241    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1456  integrase catalytic subunit  92.18 
 
 		 1038 bp  793    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1693  integrase catalytic subunit  92.18 
 
 		 1038 bp  793    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.770158  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1708  integrase catalytic subunit  92.18 
 
 		 1038 bp  793    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.420426  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2595  integrase catalytic subunit  92.18 
 
 		 1038 bp  793    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0685219  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5608  integrase catalytic subunit  92.18 
 
 		 753 bp  793    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5655  integrase catalytic subunit  92.18 
 
 		 1077 bp  793    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.935858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0861    100 
 
 		 814 bp  1241    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1721  integrase catalytic subunit  92.18 
 
 		 753 bp  793    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1671  integrase catalytic subunit  91.69 
 
 		 489 bp  565  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.212751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1112  integrase, catalytic region  91.81 
 
 		 447 bp  537  1e-150  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.329084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1668    93.71 
 
 		 294 bp  236  6e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0274769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1116    94.26 
 
 		 216 bp  186  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.353467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2014  Integrase catalytic region  90.74 
 
 		 894 bp  67.9  0.000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3520  hypothetical protein  96.97 
 
 		 171 bp  58  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.707405 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0555    90.38 
 
 		 711 bp  56  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3070    87.04 
 
 		 691 bp  52  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.817214  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1827  hypothetical protein  93.94 
 
 		 588 bp  50.1  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1167  integrase catalytic subunit  96.55 
 
 		 855 bp  50.1  0.0008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3557  hypothetical protein  93.94 
 
 		 588 bp  50.1  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1497    87.76 
 
 		 2972 bp  50.1  0.0008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21990    91.67 
 
 		 1899 bp  48.1  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0773126 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17090  transposase  91.67 
 
 		 804 bp  48.1  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.200015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08090  transposase  91.67 
 
 		 804 bp  48.1  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.757215 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1569  putative transposase  93.75 
 
 		 273 bp  48.1  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22000  transposase  91.67 
 
 		 804 bp  48.1  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.208093 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05720    91.67 
 
 		 558 bp  48.1  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04192  ISXoo3 transposase ORF B  93.75 
 
 		 846 bp  48.1  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02902    93.75 
 
 		 786 bp  48.1  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3736  integrase catalytic region  85.71 
 
 		 873 bp  48.1  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.402881 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3784  integrase catalytic subunit  96.43 
 
 		 813 bp  48.1  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1696  putative transposase  93.75 
 
 		 273 bp  48.1  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.129203  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>