42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1807 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1807  hypothetical protein  100 
 
 
134 aa  277  3e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0796576  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0578  protein of unknown function DUF123  40.19 
 
 
133 aa  88.6  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2572  hypothetical protein  44.64 
 
 
126 aa  83.2  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02280  hypothetical protein  33.65 
 
 
138 aa  75.9  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0273401  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0654  protein of unknown function DUF123  37.76 
 
 
136 aa  75.1  0.0000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0479  protein of unknown function DUF123  37.25 
 
 
134 aa  74.7  0.0000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0278  protein of unknown function DUF123  39.8 
 
 
125 aa  73.9  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0991873  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1312  hypothetical protein  34.82 
 
 
162 aa  71.2  0.000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.474029 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0625  hypothetical protein  32 
 
 
119 aa  70.9  0.000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0747  hypothetical protein  40.91 
 
 
168 aa  70.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3196  protein of unknown function DUF123  39.29 
 
 
141 aa  68.9  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3380  protein of unknown function DUF123  36.84 
 
 
153 aa  67.4  0.00000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.798744  normal  0.147915 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0776  protein of unknown function DUF123  40 
 
 
158 aa  67.4  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0198  hypothetical protein  35.14 
 
 
144 aa  66.2  0.0000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000406548  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0646  hypothetical protein  40 
 
 
154 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.269467  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1038  hypothetical protein  36.79 
 
 
146 aa  64.3  0.0000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.4343 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1071  hypothetical protein  32.41 
 
 
356 aa  62.4  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.661198  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1691  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  30.56 
 
 
356 aa  62.8  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0507  hypothetical protein  34.65 
 
 
139 aa  62.4  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0319472  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1555  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  33.33 
 
 
356 aa  62.4  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.272014 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1123  hypothetical protein  49.09 
 
 
146 aa  61.6  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0356  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  32.41 
 
 
356 aa  61.2  0.000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0334689  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1462  protein of unknown function DUF123  34.38 
 
 
142 aa  61.6  0.000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1232  hypothetical protein  35.88 
 
 
164 aa  59.7  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2695  hypothetical protein  39.6 
 
 
188 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0628  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  33.03 
 
 
357 aa  57  0.00000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0858  hypothetical protein  37.89 
 
 
165 aa  56.6  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0067  hypothetical protein  39.77 
 
 
145 aa  56.2  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0042  hypothetical protein  33.01 
 
 
146 aa  52.4  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.899596  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0898  protein of unknown function DUF123  34.55 
 
 
137 aa  52.8  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0253075  normal  0.780245 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0815  hypothetical protein  31.76 
 
 
127 aa  51.2  0.000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0265  hypothetical protein  31.82 
 
 
143 aa  50.4  0.000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0984626  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2461  hypothetical protein  35.92 
 
 
148 aa  49.3  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0396  endonuclease III  29.63 
 
 
174 aa  48.9  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2610  hypothetical protein  35.62 
 
 
192 aa  47.4  0.00008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1211  hypothetical protein  27.59 
 
 
189 aa  44.7  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.174889  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0267  hypothetical protein  28.09 
 
 
143 aa  45.1  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0194677  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0051  hypothetical protein  31.07 
 
 
151 aa  43.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0414  protein of unknown function DUF123  31.48 
 
 
144 aa  42.7  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.434904  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1958  hypothetical protein  42.22 
 
 
115 aa  40.8  0.006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0937  protein of unknown function DUF123  31.71 
 
 
128 aa  40.8  0.006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.305351  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1924  hypothetical protein  40.85 
 
 
191 aa  40  0.01  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>