17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0152 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0152  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 134 aa  280  3.0000000000000004e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2094  anti-sigma-factor antagonist  31.82 
 
 		 104 aa  48.5  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000638227  normal  0.178484 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0196  anti-sigma-factor antagonist  28.89 
 
 		 115 aa  47.4  0.00007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3452  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  39.44 
 
 		 115 aa  47  0.00009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.466044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2416  anti-sigma-factor antagonist  30.93 
 
 		 112 aa  43.9  0.0007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.015086 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1541  anti-sigma-factor antagonist (STAS)  35.48 
 
 		 99 aa  43.5  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.875009  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4364  anti-sigma-factor antagonist  35.11 
 
 		 101 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.557129 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1503  anti-sigma-factor antagonist  35.11 
 
 		 101 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.696241  normal  0.186135 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3441  anti-sigma-factor antagonist  34.25 
 
 		 100 aa  43.5  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3689  anti-sigma-factor antagonist  35.11 
 
 		 101 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1231  anti-sigma-factor antagonist  31.17 
 
 		 109 aa  42.4  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3925  anti-sigma-factor antagonist  34.04 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.406637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1390  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  30.56 
 
 		 96 aa  41.6  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2150  anti-sigma-factor antagonist  35.48 
 
 		 99 aa  41.6  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.302168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20770  hypothetical protein  50 
 
 		 101 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2820  anti-sigma-factor antagonist  42.42 
 
 		 101 aa  41.2  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0314331 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1783  hypothetical protein  50 
 
 		 101 aa  40.8  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>