19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_1588 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1038  S-layer protein  81.39 
 
 
535 aa  829    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0324  S-layer protein  83.65 
 
 
531 aa  890    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1588  S-layer protein  100 
 
 
532 aa  1052    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.733203  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0045  S-layer protein  32.38 
 
 
532 aa  246  6e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.198912  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0527  S-layer protein  33.63 
 
 
558 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1255  S-layer protein  34.4 
 
 
562 aa  240  4e-62  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1381  S-layer protein  33.87 
 
 
562 aa  229  1e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0772806  normal  0.544245 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0649  S-layer protein  33.33 
 
 
561 aa  228  3e-58  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1370  S-layer protein  32.32 
 
 
567 aa  224  2e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.487211  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0683  S-layer protein  31.79 
 
 
538 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0742683  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1780  S-layer protein  31.02 
 
 
533 aa  212  1e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.423468  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0123  S-layer protein  31.68 
 
 
532 aa  207  6e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.539086 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1193  S-layer protein  31.2 
 
 
1336 aa  111  3e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0802  S-layer protein  38.14 
 
 
444 aa  57  0.0000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.648701  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0562  S-layer protein  42.67 
 
 
437 aa  54.3  0.000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.242159  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0084  S-layer protein  25.98 
 
 
447 aa  53.5  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0119  APHP domain-containing protein  37.88 
 
 
976 aa  48.1  0.0004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0737  hypothetical protein  35.21 
 
 
447 aa  47.4  0.0007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.854836 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1181  S-layer family protein  24.77 
 
 
447 aa  46.2  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.635181  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>