14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_1381 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1255  S-layer protein  93.42 
 
 
562 aa  977    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1370  S-layer protein  66.15 
 
 
567 aa  670    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.487211  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1381  S-layer protein  100 
 
 
562 aa  1066    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0772806  normal  0.544245 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0527  S-layer protein  84.25 
 
 
558 aa  859    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0045  S-layer protein  44.56 
 
 
532 aa  396  1e-109  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.198912  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1780  S-layer protein  44.82 
 
 
533 aa  395  1e-108  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.423468  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0683  S-layer protein  43.59 
 
 
538 aa  382  1e-105  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0742683  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0649  S-layer protein  45.39 
 
 
561 aa  373  1e-102  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0123  S-layer protein  43.36 
 
 
532 aa  363  4e-99  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.539086 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1588  S-layer protein  33.33 
 
 
532 aa  253  9.000000000000001e-66  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.733203  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0324  S-layer protein  33.51 
 
 
531 aa  251  2e-65  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1193  S-layer protein  40.17 
 
 
1336 aa  237  4e-61  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1038  S-layer protein  33.04 
 
 
535 aa  230  6e-59  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0562  S-layer protein  25.14 
 
 
437 aa  50.1  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.242159  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>