23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_1193 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_1193  S-layer protein  100 
 
 
1336 aa  2660    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0135  hypothetical protein  47.37 
 
 
754 aa  284  1e-74  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0602047  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1255  S-layer protein  41.91 
 
 
562 aa  258  5e-67  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0527  S-layer protein  38.63 
 
 
558 aa  255  3e-66  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1381  S-layer protein  40.75 
 
 
562 aa  253  2e-65  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0772806  normal  0.544245 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1370  S-layer protein  35.49 
 
 
567 aa  231  5e-59  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.487211  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0119  APHP domain-containing protein  39.17 
 
 
976 aa  213  2e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0145  hypothetical protein  58.94 
 
 
712 aa  192  4e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1773  hypothetical protein  58.58 
 
 
718 aa  191  8e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00222697 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1802  hypothetical protein  58.7 
 
 
424 aa  169  4e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0194967  unclonable  0.00000000902281 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0165  hypothetical protein  46.47 
 
 
312 aa  140  2e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00021132  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0324  S-layer protein  32.22 
 
 
531 aa  139  3.0000000000000003e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0045  S-layer protein  30.09 
 
 
532 aa  127  1e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.198912  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1038  S-layer protein  34.49 
 
 
535 aa  125  6e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1588  S-layer protein  31.67 
 
 
532 aa  120  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.733203  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0683  S-layer protein  31.94 
 
 
538 aa  109  4e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0742683  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0649  S-layer protein  31.01 
 
 
561 aa  107  2e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0123  S-layer protein  30.69 
 
 
532 aa  105  5e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.539086 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1780  S-layer protein  30.8 
 
 
533 aa  105  8e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.423468  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0562  S-layer protein  42.65 
 
 
437 aa  54.3  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.242159  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1181  S-layer family protein  33.82 
 
 
447 aa  47.8  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.635181  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0737  hypothetical protein  33.82 
 
 
447 aa  46.2  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.854836 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0084  S-layer protein  35.29 
 
 
447 aa  46.2  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>