13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1780 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0683  S-layer protein  84.42 
 
 
538 aa  892    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0742683  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0045  S-layer protein  62.48 
 
 
532 aa  677    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.198912  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0123  S-layer protein  83.11 
 
 
532 aa  870    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.539086 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1780  S-layer protein  100 
 
 
533 aa  1045    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.423468  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1255  S-layer protein  44.56 
 
 
562 aa  369  1e-101  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0527  S-layer protein  43.62 
 
 
558 aa  367  1e-100  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1381  S-layer protein  44.82 
 
 
562 aa  362  1e-98  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0772806  normal  0.544245 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1370  S-layer protein  40.7 
 
 
567 aa  343  5e-93  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.487211  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0649  S-layer protein  37.9 
 
 
561 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1588  S-layer protein  30.84 
 
 
532 aa  210  5e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.733203  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1038  S-layer protein  31.17 
 
 
535 aa  209  1e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0324  S-layer protein  29.52 
 
 
531 aa  201  3e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1193  S-layer protein  28.44 
 
 
1336 aa  100  7e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>