14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0527 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1255  S-layer protein  82.3 
 
 
562 aa  837    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1370  S-layer protein  65.4 
 
 
567 aa  650    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.487211  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1381  S-layer protein  84.25 
 
 
562 aa  843    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0772806  normal  0.544245 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0527  S-layer protein  100 
 
 
558 aa  1062    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0683  S-layer protein  43.13 
 
 
538 aa  390  1e-107  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0742683  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0045  S-layer protein  43.21 
 
 
532 aa  386  1e-106  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.198912  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1780  S-layer protein  43.62 
 
 
533 aa  387  1e-106  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.423468  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0649  S-layer protein  45.64 
 
 
561 aa  378  1e-103  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0123  S-layer protein  42.38 
 
 
532 aa  365  1e-99  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.539086 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1588  S-layer protein  33.39 
 
 
532 aa  259  1e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.733203  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0324  S-layer protein  33.45 
 
 
531 aa  251  2e-65  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1193  S-layer protein  38.36 
 
 
1336 aa  241  2e-62  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1038  S-layer protein  32.39 
 
 
535 aa  238  2e-61  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0562  S-layer protein  23.76 
 
 
437 aa  55.5  0.000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.242159  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>