27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0266 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0266  RNA polymerase Rpb6  100 
 
 		 58 aa  116  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0572  RNA polymerase Rpb6  93.1 
 
 		 58 aa  111  3e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.624479  normal  0.168113 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1346  RNA polymerase Rpb6  92.98 
 
 		 59 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.222064  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0638  RNA polymerase Rpb6  89.29 
 
 		 56 aa  103  1e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1093  RNA polymerase Rpb6  63.79 
 
 		 61 aa  70.5  0.000000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2392  DNA-directed RNA polymerase, subunit K  49.09 
 
 		 63 aa  61.6  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000536412  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0479  RNA polymerase Rpb6  46.43 
 
 		 60 aa  58.5  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2380  RNA polymerase Rpb6  47.06 
 
 		 56 aa  58.5  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000413044  normal  0.621236 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1424  DNA-directed RNA polymerase, subunit K  50 
 
 		 60 aa  58.2  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0159799 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1239  hypothetical protein  44.44 
 
 		 62 aa  55.5  0.0000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0363462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1808  RNA polymerase Rpb6  45.1 
 
 		 55 aa  55.1  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.697543  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1824  RNA polymerase Rpb6  38.18 
 
 		 59 aa  55.5  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0428  RNA polymerase Rpb6  44.23 
 
 		 58 aa  54.3  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2546  RNA polymerase Rpb6  42 
 
 		 61 aa  53.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2597  RNA polymerase Rpb6  40 
 
 		 58 aa  52.8  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.533381  normal  0.132481 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2516  RNA polymerase Rpb6  38.46 
 
 		 58 aa  52  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.803203  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0929  RNA polymerase Rpb6  43.64 
 
 		 57 aa  52  0.000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2217  RNA polymerase Rpb6  43.14 
 
 		 57 aa  52  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1888  RNA polymerase Rpb6  37.5 
 
 		 95 aa  51.6  0.000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.216577  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2894  RNA polymerase Rpb6  43.14 
 
 		 55 aa  50.8  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.003737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0290  RNA polymerase Rpb6  44.44 
 
 		 81 aa  48.9  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.030804  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_10148  predicted protein  42.31 
 
 		 129 aa  48.5  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.313953  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0932  RNA polymerase Rpb6  43.4 
 
 		 182 aa  47.4  0.00006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.186024 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_8797  predicted protein  36.54 
 
 		 81 aa  43.9  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.76808  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02747  DNA-directed RNA polymerase I, II, and III subunit Rpb6 (AFU_orthologue; AFUA_1G05160)  42.31 
 
 		 198 aa  43.9  0.0007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0516525  normal  0.594971 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1673  DNA-directed RNA polymerase, subunit K  36.21 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0083987  normal  0.431934 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60409  subunit common to RNA polymerases I, II, and III  40.38 
 
 		 157 aa  43.5  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.7613 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>