20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2945 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2945  hypothetical protein  100 
 
 
288 aa  575  1.0000000000000001e-163  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0374  periplasmic ATP/GTP-binding protein  27.5 
 
 
288 aa  114  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3843  NHL repeat containing protein  25.87 
 
 
282 aa  95.5  9e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1927  ATP/GTP-binding  27.44 
 
 
275 aa  83.6  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0980  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  25.86 
 
 
445 aa  80.1  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0105637 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2979  ATP/GTP-binding  25.44 
 
 
277 aa  70.9  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0296682  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3578  ATP/GTP-binding  26.7 
 
 
308 aa  66.6  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.723443  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2273  hypothetical protein  28.77 
 
 
294 aa  60.1  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0453  periplasmic ATP/GTP-binding protein  24.74 
 
 
273 aa  57.4  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.879062  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0124  conserved hypothetical protein, probable ATP/GTP-binding protein  24.45 
 
 
278 aa  53.9  0.000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.305705  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0535  NHL repeat-containing protein  23.91 
 
 
642 aa  47.8  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000386483  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4408  NHL repeat-containing protein  27.48 
 
 
538 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2603  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  25.5 
 
 
331 aa  45.4  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.776475  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4495  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.48 
 
 
538 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.789599  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3498  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  34.88 
 
 
413 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0371184  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1062  hypothetical protein  26.29 
 
 
283 aa  44.3  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.930441  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1185  hypothetical protein  25.82 
 
 
283 aa  43.9  0.003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.561185  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3441  hypothetical protein  32.97 
 
 
422 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2140  gluconolactonase  28.07 
 
 
296 aa  42.7  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.977178 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5084  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  34.78 
 
 
316 aa  42.7  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>