23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2757 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2757    100 
 
 		 786 bp  1558    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3126  integrase catalytic subunit  80.68 
 
 		 798 bp  79.8  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3247  integrase catalytic subunit  80.68 
 
 		 798 bp  79.8  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00558432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3535  integrase catalytic subunit  80.68 
 
 		 798 bp  79.8  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.323423  normal  0.557897 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2970  integrase catalytic subunit  80.68 
 
 		 798 bp  79.8  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0996434 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5526  Integrase catalytic region  83.87 
 
 		 783 bp  65.9  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.109818 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1112  Integrase catalytic region  83.87 
 
 		 783 bp  65.9  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.323234 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4821  transposase  80.25 
 
 		 357 bp  65.9  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.188807 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1119    84.62 
 
 		 741 bp  60  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.112614 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4611    79.74 
 
 		 387 bp  58  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0616505 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0441  integrase catalytic region  87.27 
 
 		 840 bp  54  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.110873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2633  integrase catalytic region  87.27 
 
 		 840 bp  54  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.348098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2926  integrase catalytic region  87.27 
 
 		 840 bp  54  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4739  integrase catalytic region  87.27 
 
 		 840 bp  54  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6105  integrase catalytic region  87.27 
 
 		 840 bp  54  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1303  transposase  85.96 
 
 		 918 bp  50.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1439  ISRSO12-transposase ORFB protein  85.96 
 
 		 705 bp  50.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1901  integrase catalytic region  81.72 
 
 		 474 bp  50.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455468  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0504  ISRSO12-transposase ORFB protein  85.96 
 
 		 705 bp  50.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05623  transposase  85.96 
 
 		 918 bp  50.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2706  ISRSO12-transposase ORFB protein  85.96 
 
 		 705 bp  50.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.147887 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3901  cache type 2 domain-containing protein  87.5 
 
 		 1032 bp  48.1  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1659    96.43 
 
 		 240 bp  48.1  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>