18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2180 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_2180  solute binding protein-like protein  100 
 
 
862 aa  1717    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.521964  normal  0.207273 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0149  solute binding protein-like protein  41.69 
 
 
895 aa  653    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.450727  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1074  solute binding protein-like protein  60.05 
 
 
843 aa  991    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.297086  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1065  oligopeptide binding protein, putative  40.69 
 
 
701 aa  563  1.0000000000000001e-159  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000159871  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0618  solute binding protein-like protein  23.11 
 
 
820 aa  217  9e-55  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1418  cell wall anchor domain-containing protein  29.55 
 
 
863 aa  213  2e-53  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.939763  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0975  oligopeptide binding protein, putative  29.46 
 
 
867 aa  207  8e-52  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.200479 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0913  cell wall anchor domain-containing protein  27.51 
 
 
868 aa  197  5.000000000000001e-49  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.694923 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1897  cell wall anchor domain-containing protein  28.37 
 
 
878 aa  194  7e-48  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2228  conserved hypothetical protein  22.57 
 
 
903 aa  144  8e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1072  putative lipoprotein  22.76 
 
 
871 aa  127  9e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000214841  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0396  extracellular solute-binding protein family 5  21.51 
 
 
868 aa  125  3e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0800  solute binding protein-like protein  22.36 
 
 
919 aa  124  9e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13080  lipoprotein, putative  21.96 
 
 
612 aa  82  0.00000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2258  extracellular solute-binding protein family 5  25.62 
 
 
591 aa  47  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000752385  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1161  extracellular solute-binding protein  24 
 
 
775 aa  45.4  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1571  4-phytase  29.55 
 
 
510 aa  45.1  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.624152  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2012  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  21.4 
 
 
545 aa  44.7  0.008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>