14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_5548 on replicon NC_008703
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008703  Mkms_5548  phage integrase family protein  100 
 
 		 276 aa  555  1e-157  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0907642 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2542  integrase domain-containing protein  48.46 
 
 		 554 aa  226  3e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2737  integrase domain-containing protein  48.46 
 
 		 554 aa  226  3e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3447  hypothetical protein  46.95 
 
 		 544 aa  223  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.157505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6373  hypothetical protein  41.91 
 
 		 422 aa  171  7.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4727  hypothetical protein  31.54 
 
 		 590 aa  86.3  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4276  hypothetical protein  33.46 
 
 		 560 aa  84  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4216  hypothetical protein  33.59 
 
 		 573 aa  80.1  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4722  hypothetical protein  33.52 
 
 		 230 aa  78.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0046  hypothetical protein  38.81 
 
 		 114 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0476  phage integrase family protein  26.96 
 
 		 544 aa  45.8  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.565633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5941  phage integrase family protein  26.96 
 
 		 544 aa  45.8  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.345865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0580  phage integrase family protein  26.96 
 
 		 547 aa  45.8  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0519  phage integrase family protein  28.93 
 
 		 300 aa  42  0.01  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.24612  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>