22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0868 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_0868  putative cytochrome c biogenesis protein  100 
 
 
238 aa  462  1e-129  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.87484  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2348  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  46.22 
 
 
232 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.170382  hitchhiker  0.0013358 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3833  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  46.22 
 
 
232 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1213  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  44.44 
 
 
234 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1725  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.64 
 
 
243 aa  100  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1904  hypothetical protein  30.13 
 
 
226 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0583219  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1738  cytochrome c biogenesis protein  30.53 
 
 
226 aa  93.2  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.143113  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1934  hypothetical protein  30.53 
 
 
238 aa  92.8  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.84002e-47 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1761  hypothetical protein  30.09 
 
 
226 aa  92.8  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000352618  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1710  cytochrome c biogenesis protein  30.09 
 
 
226 aa  92.8  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00062962  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1899  hypothetical protein  30.09 
 
 
226 aa  92.8  5e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000526898  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0198  hypothetical protein  27.85 
 
 
231 aa  87  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.604148  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0268  cytochrome c biogenesis protein  27.85 
 
 
231 aa  87  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1701  hypothetical protein  29.36 
 
 
242 aa  85.9  6e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.310269  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1322  cytochrome c biogenesis protein CcdA  25.64 
 
 
242 aa  50.1  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1357  hypothetical protein  30.34 
 
 
218 aa  48.5  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0221939  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2275  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.5 
 
 
242 aa  47  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3483  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  26.47 
 
 
235 aa  45.8  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.510925  normal  0.220694 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1909  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.75 
 
 
234 aa  45.4  0.0007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00531601  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0997  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.12 
 
 
415 aa  43.9  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.319057  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4210  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  26.82 
 
 
245 aa  43.9  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2887  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  23.87 
 
 
236 aa  41.6  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>