52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1704 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_1704  thiamineS protein  100 
 
 
82 aa  158  3e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5048  thiamineS protein  71.95 
 
 
88 aa  102  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.501283  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4861  thiamineS protein  70.73 
 
 
88 aa  97.4  6e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0539176 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4478  thiamineS  70.73 
 
 
88 aa  97.4  6e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.605033  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4565  thiamineS protein  70.73 
 
 
88 aa  97.4  6e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0626393 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10885  molybdenum cofactor biosynthesis protein D 2 moaD2  64.63 
 
 
92 aa  82  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  3.91513e-26  normal  0.142298 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1232  thiamine S protein  62.2 
 
 
82 aa  79  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.895224  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0470  thiamineS protein  50 
 
 
87 aa  75.1  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34170  molybdopterin converting factor, small subunit  49.38 
 
 
103 aa  73.6  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.176144  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4962  thiamineS protein  50.62 
 
 
82 aa  69.7  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.806952  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0822  thiamineS protein  55.13 
 
 
79 aa  67.4  0.00000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0182275  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1439  thiamineS protein  48.86 
 
 
88 aa  64.7  0.0000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0227652  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2024  thiamineS protein  51.19 
 
 
92 aa  64.3  0.0000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.930246  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4752  thiamineS protein  51.09 
 
 
100 aa  63.5  0.0000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1754  thiamineS protein  51.85 
 
 
94 aa  63.5  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.593582  hitchhiker  0.00626115 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1443  thiamineS protein  50 
 
 
88 aa  60.8  0.000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000277571 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20020  hypothetical protein  41.46 
 
 
79 aa  59.3  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00891223 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0445  thiamine S  49.41 
 
 
97 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3626  thiamineS protein  55.56 
 
 
92 aa  57.4  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.014511  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1691  thiamineS protein  45 
 
 
103 aa  52.4  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.319795  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0596  thiamineS protein  47.62 
 
 
84 aa  52.4  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4537  thiamineS protein  46.91 
 
 
98 aa  48.9  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.708821 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2736  putative molybdopterin converting factor  43.53 
 
 
102 aa  47.8  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5047  thiamineS protein  44.44 
 
 
99 aa  47.8  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0107855 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2201  molybdopterin converting factor, subunit 1  35.29 
 
 
87 aa  45.8  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00732889  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0934  molybdopterin converting factor, subunit 1  34.12 
 
 
85 aa  45.4  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0356  thiamineS protein  49.38 
 
 
79 aa  44.7  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1381  molybdopterin converting factor, subunit 1  34.12 
 
 
85 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2393  molybdopterin converting factor, subunit 1  34.12 
 
 
85 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1143  molybdopterin converting factor, subunit 1  34.12 
 
 
85 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0546773  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2266  molybdopterin converting factor, subunit 1  34.12 
 
 
85 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1871  molybdopterin converting factor, subunit 1  34.12 
 
 
85 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0025  molybdopterin converting factor, subunit 1  34.12 
 
 
85 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.129719  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2228  molybdopterin converting factor, subunit 1  34.12 
 
 
85 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.423824  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2368  MoaD family protein  26.83 
 
 
228 aa  43.1  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.467874  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01049  molybdopterin converting factor, small subunit  25.61 
 
 
82 aa  43.1  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.286152  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1422  molybdopterin converting factor, subunit 1  34.12 
 
 
85 aa  43.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0783343  hitchhiker  0.00713851 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1761  molybdopterin converting factor, subunit 1  35.29 
 
 
85 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.336452 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2591  molybdopterin converting factor, subunit 1  30.59 
 
 
85 aa  42.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.257626  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1545  molybdopterin synthase subunit MoaD  34.12 
 
 
84 aa  42.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1242  molybdopterin synthase subunit MoaD  40.96 
 
 
95 aa  42.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00579746 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1789  molybdopterin converting factor, subunit 1  35.29 
 
 
85 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2923  molybdopterin converting factor, subunit 1  37.04 
 
 
237 aa  42.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.253971  normal  0.914332 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13354  moaD-moaE fusion protein moaX  36.25 
 
 
221 aa  41.6  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00273279  normal  0.249285 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0896  molybdopterin converting factor, subunit 1  39.29 
 
 
83 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2021  molybdopterin converting factor, subunit 1  34.52 
 
 
83 aa  41.6  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1180  molybdopterin converting factor, subunit 1  39.76 
 
 
217 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1155  molybdopterin converting factor, subunit 1  34.12 
 
 
85 aa  41.2  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.291215 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1248  molybdopterin converting factor, subunit 1  40.96 
 
 
217 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.460975  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0441  molybdopterin converting factor, subunit 1  31.82 
 
 
85 aa  41.2  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2668  MoaD family protein  34.09 
 
 
111 aa  40.8  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.390258  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0189  hypothetical protein  32.26 
 
 
92 aa  40.4  0.008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.356126  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>