35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_4861 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4478  thiamineS  100 
 
 
88 aa  172  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.605033  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4565  thiamineS protein  100 
 
 
88 aa  172  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0626393 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4861  thiamineS protein  100 
 
 
88 aa  172  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0539176 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5048  thiamineS protein  64.77 
 
 
88 aa  95.1  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.501283  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1704  thiamineS protein  70.73 
 
 
82 aa  95.1  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10885  molybdenum cofactor biosynthesis protein D 2 moaD2  59.76 
 
 
92 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  3.91513e-26  normal  0.142298 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0470  thiamineS protein  52.33 
 
 
87 aa  79.3  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34170  molybdopterin converting factor, small subunit  49.38 
 
 
103 aa  75.9  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.176144  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0822  thiamineS protein  57.69 
 
 
79 aa  71.2  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0182275  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4962  thiamineS protein  50 
 
 
82 aa  71.6  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.806952  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1754  thiamineS protein  54.22 
 
 
94 aa  68.6  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.593582  hitchhiker  0.00626115 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1439  thiamineS protein  47.67 
 
 
88 aa  64.7  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0227652  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1443  thiamineS protein  50 
 
 
88 aa  64.7  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000277571 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1232  thiamine S protein  54.88 
 
 
82 aa  63.9  0.0000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.895224  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4752  thiamineS protein  50.52 
 
 
100 aa  63.9  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3626  thiamineS protein  55.56 
 
 
92 aa  62.8  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.014511  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2024  thiamineS protein  48.81 
 
 
92 aa  61.6  0.000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.930246  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20020  hypothetical protein  40 
 
 
79 aa  54.7  0.0000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00891223 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4537  thiamineS protein  46.43 
 
 
98 aa  54.7  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.708821 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0596  thiamineS protein  46.43 
 
 
84 aa  53.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0445  thiamine S  42.05 
 
 
97 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1691  thiamineS protein  45.68 
 
 
103 aa  52.4  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.319795  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5047  thiamineS protein  44.71 
 
 
99 aa  50.4  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0107855 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08550  ThiS family protein  46.67 
 
 
100 aa  49.3  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.266586  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0356  thiamineS protein  53.66 
 
 
79 aa  46.2  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2368  MoaD family protein  26.83 
 
 
228 aa  43.9  0.0007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.467874  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1833  thiamineS protein  34.33 
 
 
99 aa  43.5  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.308213  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1242  molybdopterin synthase subunit MoaD  38.89 
 
 
95 aa  42.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00579746 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6174  thiamineS protein  46.43 
 
 
84 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.156031 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2923  molybdopterin converting factor, subunit 1  33.72 
 
 
237 aa  42  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.253971  normal  0.914332 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3195  molybdopterin converting factor, subunit 1  34.52 
 
 
238 aa  41.2  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1248  molybdopterin converting factor, subunit 1  41.98 
 
 
217 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.460975  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1180  molybdopterin converting factor, subunit 1  40.74 
 
 
217 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01049  molybdopterin converting factor, small subunit  29.55 
 
 
82 aa  40.4  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.286152  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0454  thiamineS protein  41.98 
 
 
82 aa  40  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.132954  normal  0.504318 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>