21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0454 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0454  thiamineS protein  100 
 
 
82 aa  160  5.0000000000000005e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.132954  normal  0.504318 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0896  molybdopterin converting factor, subunit 1  65.06 
 
 
83 aa  85.9  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0596  thiamineS protein  60.71 
 
 
84 aa  85.5  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2024  thiamineS protein  54.43 
 
 
92 aa  85.1  3e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.930246  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0445  thiamine S  51.19 
 
 
97 aa  80.9  0.000000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2736  putative molybdopterin converting factor  54.12 
 
 
102 aa  73.6  0.0000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8251  thiamineS protein  61.18 
 
 
83 aa  73.2  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4962  thiamineS protein  53.01 
 
 
82 aa  66.2  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.806952  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4239  thiamineS protein  42.17 
 
 
90 aa  57.4  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.312253  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6174  thiamineS protein  52.38 
 
 
84 aa  54.3  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.156031 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4375  thiamineS protein  47.06 
 
 
85 aa  48.5  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1439  thiamineS protein  45.56 
 
 
88 aa  47  0.00009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0227652  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1443  thiamineS protein  41.57 
 
 
88 aa  44.3  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000277571 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0470  thiamineS protein  38.89 
 
 
87 aa  43.9  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34170  molybdopterin converting factor, small subunit  39.77 
 
 
103 aa  43.9  0.0008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.176144  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0225  molybdopterin converting factor, subunit 1  32.5 
 
 
80 aa  43.5  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000241588  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08550  ThiS family protein  47.54 
 
 
100 aa  42.4  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.266586  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4861  thiamineS protein  41.98 
 
 
88 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0539176 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4565  thiamineS protein  41.98 
 
 
88 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0626393 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4478  thiamineS  41.98 
 
 
88 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.605033  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5048  thiamineS protein  41.46 
 
 
88 aa  41.2  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.501283  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>