60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_0701 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007947  Mfla_0701  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  100 
 
 		 68 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0194484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2993  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  53.12 
 
 		 69 aa  71.2  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0344  cytochrome oxidase maturation protein cbb3-type  61.7 
 
 		 61 aa  66.6  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00994318 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0165  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  55.36 
 
 		 73 aa  64.7  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1052  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  56.86 
 
 		 71 aa  62.8  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1364  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  54.17 
 
 		 59 aa  55.1  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.540828 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5919  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  40 
 
 		 87 aa  53.9  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.662161 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0452  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  50 
 
 		 58 aa  53.5  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0935391  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2359  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  53.7 
 
 		 65 aa  53.1  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98342 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4262  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  45.83 
 
 		 71 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.336957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1606  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  45.83 
 
 		 71 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0765964  normal  0.010544 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1791  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  45.83 
 
 		 78 aa  51.6  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1156  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  41.38 
 
 		 74 aa  51.6  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.206736  normal  0.0826721 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2611  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  42.86 
 
 		 68 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.38073  normal  0.51835 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1370  cytochrome oxidase maturation protein cbb3-type  50 
 
 		 54 aa  51.2  0.000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.938434  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0712  cytochrome oxidase maturation protein cbb3-type  44.07 
 
 		 63 aa  50.8  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000720002  normal  0.26244 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3827  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  43.75 
 
 		 71 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3580  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  43.75 
 
 		 70 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1995  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  34.33 
 
 		 67 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.407314  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1815  cytochrome oxidase maturation protein cbb3-type  41.67 
 
 		 70 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19940  cbb3-type cytochrome oxidase maturation protein  43.75 
 
 		 73 aa  48.5  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.225111  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1276  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  48.89 
 
 		 84 aa  48.5  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2415  secretion protein HlyD  40 
 
 		 68 aa  48.5  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2045  cytochrome oxidase maturation protein cbb3-type  60.61 
 
 		 67 aa  47.4  0.00006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0103953  normal  0.644275 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2045  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  39.58 
 
 		 48 aa  47.4  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00305022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2394  cytochrome oxidase maturation protein cbb3-type  48.98 
 
 		 49 aa  47  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1525  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  53.33 
 
 		 55 aa  45.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44450  hypothetical protein  66.67 
 
 		 69 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00324047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3784  hypothetical protein  66.67 
 
 		 69 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0376969  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1178  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  49.02 
 
 		 67 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2042  cytochrome oxidase maturation protein cbb3-type  37.5 
 
 		 48 aa  44.3  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.589343  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2082  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  48 
 
 		 63 aa  44.3  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000292498  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1874  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  32.84 
 
 		 77 aa  43.9  0.0007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.308145  normal  0.762783 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1103  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  39.58 
 
 		 59 aa  43.9  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0784477  normal  0.590624 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1196  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  39.58 
 
 		 59 aa  43.9  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0933  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  35.82 
 
 		 70 aa  43.5  0.0009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.177633  normal  0.669398 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5023  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  47.92 
 
 		 52 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.156447  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4955  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  50 
 
 		 52 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000981596  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1275  signal peptide protein  37.5 
 
 		 58 aa  43.5  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.695713 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0462  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  54.29 
 
 		 52 aa  43.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2256  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  43.4 
 
 		 56 aa  43.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0217106  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0466  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  66.67 
 
 		 69 aa  42.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.160006  normal  0.286886 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1340  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  51.02 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.131657  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1137  hypothetical protein  36.07 
 
 		 55 aa  42.4  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0106882  normal  0.952365 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02297  hypothetical protein  36.17 
 
 		 54 aa  42  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003473  type cbb3 cytochrome oxidase biogenesis protein CcoS involved in heme b insertion  36.17 
 
 		 54 aa  42  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.314107  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1238  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  51.02 
 
 		 66 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0008  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  41.67 
 
 		 59 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1575  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  54.29 
 
 		 60 aa  41.6  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0737  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  56.76 
 
 		 55 aa  41.2  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.95036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2571  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  40.82 
 
 		 49 aa  41.2  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.831521  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5928  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  47.92 
 
 		 68 aa  41.2  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.657419 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7464  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  44.68 
 
 		 45 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.182842  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0371  cytochrome oxidase maturation protein, Cbb3-type  69.57 
 
 		 52 aa  40.8  0.007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.156839  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0356  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  69.57 
 
 		 52 aa  40.8  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0668  nitrogen fixation protein fixS  48.08 
 
 		 52 aa  40.4  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6714  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  42.55 
 
 		 45 aa  40.4  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1845  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  37.5 
 
 		 89 aa  40.4  0.009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.224574  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1569  cytochrome oxidase maturation protein (cbb3-t)  36.96 
 
 		 56 aa  40.4  0.009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.246942  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1814  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  40.43 
 
 		 62 aa  40.4  0.009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.69622  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>