27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1442 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1442  hypothetical protein  100 
 
 		 152 aa  304  3e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.339439 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1717  protein of unknown function DUF1636  97.37 
 
 		 154 aa  269  1e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131158  hitchhiker  0.00708925 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1439  protein of unknown function DUF1636  90.7 
 
 		 129 aa  215  2e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.926113  normal  0.434429 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3113  hypothetical protein  63.25 
 
 		 133 aa  136  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0155825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2147  protein of unknown function DUF1636  60.5 
 
 		 118 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.426113  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2435  hypothetical protein  62.18 
 
 		 118 aa  127  6e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.819641  normal  0.169893 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2208  hypothetical protein  47.66 
 
 		 167 aa  105  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.61991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1891  hypothetical protein  49.17 
 
 		 142 aa  96.3  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.432746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1516  hypothetical protein  45.53 
 
 		 119 aa  95.9  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.214468  normal  0.0632804 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3288  hypothetical protein  40.91 
 
 		 156 aa  93.6  8e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0275499  normal  0.685943 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0639  hypothetical protein  41.67 
 
 		 195 aa  91.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2829  hypothetical protein  44.26 
 
 		 119 aa  90.5  7e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.309089  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1466  hypothetical protein  45.9 
 
 		 119 aa  89.7  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0121167  normal  0.991272 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0784  protein of unknown function DUF1636  43.7 
 
 		 143 aa  85.5  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2530  hypothetical protein  46.34 
 
 		 117 aa  84.7  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0741  hypothetical protein  41.67 
 
 		 180 aa  82  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.645608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2934  hypothetical protein  40.83 
 
 		 139 aa  80.5  0.000000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0112187  hitchhiker  0.00298069 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2408  protein of unknown function DUF1636  34.96 
 
 		 134 aa  75.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0160265  normal  0.924945 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3142  hypothetical protein  47.5 
 
 		 79 aa  75.9  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.716998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0158  hypothetical protein  32.52 
 
 		 136 aa  73.2  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1547  hypothetical protein  34.06 
 
 		 142 aa  71.2  0.000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0255  hypothetical protein  38.96 
 
 		 130 aa  64.7  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000015466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0227  hypothetical protein  38.27 
 
 		 129 aa  63.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0329  hypothetical protein  29.23 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0559  protein of unknown function DUF1636  30.95 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0167  protein of unknown function DUF1636  28.46 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.439841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2221  hypothetical protein  28.21 
 
 		 127 aa  40.4  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>