30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1166 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0275  hypothetical protein  86.99 
 
 		 582 aa  984    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1166  hypothetical protein  100 
 
 		 584 aa  1164    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.981297  normal  0.431954 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1326  hypothetical protein  98.8 
 
 		 584 aa  1149    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.157245  normal  0.783415 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3603  hypothetical protein  47.58 
 
 		 489 aa  369  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0158182 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4221  hypothetical protein  46.91 
 
 		 424 aa  324  3e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.287374  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5234  hypothetical protein  28.29 
 
 		 443 aa  150  8e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1740  hypothetical protein  25.94 
 
 		 443 aa  137  5e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130481  normal  0.345273 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2312  hypothetical protein  28.29 
 
 		 516 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0998  hypothetical protein  28.29 
 
 		 521 aa  135  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.464233  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1389  hypothetical protein  28.4 
 
 		 519 aa  134  5e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0145  hypothetical protein  28.29 
 
 		 478 aa  133  7.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.955464  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0503  hypothetical protein  28.29 
 
 		 478 aa  133  9e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1084  hypothetical protein  28.05 
 
 		 521 aa  133  9e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4269  hypothetical protein  31.03 
 
 		 433 aa  114  4.0000000000000004e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3508  hypothetical protein  23.86 
 
 		 411 aa  73.2  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.492379 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1246  hypothetical protein  26.81 
 
 		 411 aa  67  0.0000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.422175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1134  hypothetical protein  26.56 
 
 		 411 aa  67  0.0000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2152  hypothetical protein  26.44 
 
 		 419 aa  65.9  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.191096 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4644  hypothetical protein  23.19 
 
 		 410 aa  66.2  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.844377 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0373  hypothetical protein  26.6 
 
 		 416 aa  63.5  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1278  hypothetical protein  26.58 
 
 		 411 aa  62.8  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.815618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3727  hypothetical protein  24.39 
 
 		 410 aa  58.5  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.291811 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3706  secretion protein HlyD family protein  25.6 
 
 		 348 aa  51.6  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3990  secretion protein HlyD family protein  31.16 
 
 		 383 aa  48.5  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.302523  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4276  secretion protein HlyD  31.13 
 
 		 297 aa  45.8  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0327554  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2468  secretion protein HlyD family protein  24.24 
 
 		 393 aa  45.1  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2004  secretion protein HlyD family protein  28.28 
 
 		 380 aa  44.3  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6769  secretion protein HlyD family protein  22.94 
 
 		 393 aa  44.3  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4935  RND family efflux transporter MFP subunit  30.88 
 
 		 316 aa  44.3  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.659289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3470  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.29 
 
 		 379 aa  43.9  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.430372  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>