16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0543 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009634  Mevan_0543  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 354 aa  720    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0476  DNA polymerase beta subunit  76 
 
 		 351 aa  555  1e-157  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.115268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0361  DNA polymerase beta subunit  76 
 
 		 352 aa  552  1e-156  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.10679  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1443  DNA polymerase beta subunit  75.14 
 
 		 351 aa  543  1e-153  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0877  DNA polymerase, beta-like region  52.6 
 
 		 382 aa  394  1e-108  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0052  hypothetical protein  35.63 
 
 		 309 aa  186  4e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0461  DNA polymerase beta subunit  35.43 
 
 		 311 aa  175  9e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1924  hypothetical protein  34 
 
 		 313 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.618938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0563  hypothetical protein  35.92 
 
 		 309 aa  172  5.999999999999999e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.411197  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2732  hypothetical protein  30.37 
 
 		 317 aa  156  4e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.701847  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0617  hypothetical protein  35.59 
 
 		 298 aa  154  2e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0437  hypothetical protein  32.67 
 
 		 308 aa  150  3e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.347736  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1976  hypothetical protein  31.09 
 
 		 310 aa  144  2e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.33772  normal  0.678453 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0135  hypothetical protein  30.66 
 
 		 311 aa  140  3e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.679297  normal  0.183583 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4347  putative signal transduction protein with Nacht domain  26.62 
 
 		 1008 aa  44.7  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.647277  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1193  DNA polymerase beta domain protein region  21.81 
 
 		 299 aa  42.7  0.009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>