16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0461 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_0461  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 
311 aa  627  1e-179  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1924  hypothetical protein  53.59 
 
 
313 aa  339  2.9999999999999998e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.618938  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0052  hypothetical protein  54.9 
 
 
309 aa  337  9.999999999999999e-92  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0437  hypothetical protein  47.88 
 
 
308 aa  280  2e-74  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.347736  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0617  hypothetical protein  44.3 
 
 
298 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1976  hypothetical protein  42.43 
 
 
310 aa  253  3e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.33772  normal  0.678453 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0563  hypothetical protein  41.5 
 
 
309 aa  249  5e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.411197  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0135  hypothetical protein  43.32 
 
 
311 aa  241  9e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.679297  normal  0.183583 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0361  DNA polymerase beta subunit  34.57 
 
 
352 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.10679  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0476  DNA polymerase beta subunit  34.29 
 
 
351 aa  179  4.999999999999999e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.115268  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1443  DNA polymerase beta subunit  34 
 
 
351 aa  175  9e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2732  hypothetical protein  38.1 
 
 
317 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.701847  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0543  DNA polymerase beta subunit  35.43 
 
 
354 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0877  DNA polymerase, beta-like region  28.72 
 
 
382 aa  147  3e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0125  hypothetical protein  23.4 
 
 
296 aa  48.5  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00861839  hitchhiker  0.000869634 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1193  DNA polymerase beta domain protein region  21.33 
 
 
299 aa  45.1  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>