16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1443 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0361  DNA polymerase beta subunit  92.57 
 
 		 352 aa  660    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.10679  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0476  DNA polymerase beta subunit  90.88 
 
 		 351 aa  655    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.115268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1443  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 351 aa  711    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0543  DNA polymerase beta subunit  75.14 
 
 		 354 aa  527  1e-148  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0877  DNA polymerase, beta-like region  51.82 
 
 		 382 aa  402  1e-111  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0052  hypothetical protein  35.82 
 
 		 309 aa  188  1e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1924  hypothetical protein  33.71 
 
 		 313 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.618938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0461  DNA polymerase beta subunit  34 
 
 		 311 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0563  hypothetical protein  36.68 
 
 		 309 aa  168  1e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.411197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0617  hypothetical protein  34.73 
 
 		 298 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2732  hypothetical protein  29.8 
 
 		 317 aa  159  7e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.701847  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1976  hypothetical protein  31.81 
 
 		 310 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.33772  normal  0.678453 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0135  hypothetical protein  31.81 
 
 		 311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.679297  normal  0.183583 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0437  hypothetical protein  31.44 
 
 		 308 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.347736  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1193  DNA polymerase beta domain protein region  25.39 
 
 		 299 aa  53.5  0.000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0125  hypothetical protein  23.77 
 
 		 296 aa  48.1  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00861839  hitchhiker  0.000869634 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>