21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2348 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_2780  hypothetical protein  84.09 
 
 
397 aa  693    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3811  hypothetical protein  78.91 
 
 
396 aa  642    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.569688 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2348  hypothetical protein  100 
 
 
398 aa  810    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.231215  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1467  hypothetical protein  82.58 
 
 
402 aa  678    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4578  hypothetical protein  86.08 
 
 
397 aa  710    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.125119 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4026  hypothetical protein  84.09 
 
 
397 aa  698    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.262825  normal  0.0739843 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0570  hypothetical protein  85.89 
 
 
398 aa  713    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.23466  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6189  hypothetical protein  74.05 
 
 
396 aa  624  1e-177  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00165086 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4925  hypothetical protein  74.74 
 
 
396 aa  619  1e-176  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0193  hypothetical protein  76.05 
 
 
398 aa  614  1e-175  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0772  hypothetical protein  74.69 
 
 
403 aa  612  9.999999999999999e-175  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.447224 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0478  hypothetical protein  75.79 
 
 
401 aa  607  1e-173  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2857  hypothetical protein  74.19 
 
 
403 aa  607  9.999999999999999e-173  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.121635 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1047  hypothetical protein  72.91 
 
 
398 aa  600  1e-170  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.947339  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1544  hypothetical protein  52.3 
 
 
402 aa  398  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.885517  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4145  hypothetical protein  83.82 
 
 
235 aa  311  1e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0608  two component transcriptional regulator  74.57 
 
 
393 aa  268  1e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0841  hypothetical protein  80.25 
 
 
167 aa  266  5e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.586308  hitchhiker  0.00403969 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4137  hypothetical protein  69.64 
 
 
172 aa  240  4e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.339892  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2917  hypothetical protein  28 
 
 
308 aa  45.8  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0283  hypothetical protein  25.79 
 
 
318 aa  45.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>