30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2342 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_2342  hypothetical protein  100 
 
 		 118 aa  230  6e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7420  hypothetical protein  65.08 
 
 		 118 aa  77.8  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3915  hypothetical protein  61.19 
 
 		 107 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0529  hypothetical protein  60 
 
 		 108 aa  73.9  0.0000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.202922  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3561  hypothetical protein  58.21 
 
 		 107 aa  73.6  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3524  hypothetical protein  59.09 
 
 		 120 aa  72.8  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.898336  normal  0.799269 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1211  hypothetical protein  59.09 
 
 		 120 aa  72.8  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1518  hypothetical protein  56.52 
 
 		 107 aa  73.2  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.54718  normal  0.0915723 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0369  hypothetical protein  57.58 
 
 		 107 aa  72  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0576  hypothetical protein  56.72 
 
 		 108 aa  72.4  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0348257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0715  hypothetical protein  57.58 
 
 		 108 aa  71.6  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.319092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2791  protein of unknown function DUF736  58.46 
 
 		 108 aa  70.9  0.000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.912107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4020  hypothetical protein  55.22 
 
 		 136 aa  70.9  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0700906 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2862  hypothetical protein  52.38 
 
 		 108 aa  70.5  0.000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0535731  normal  0.116122 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3070  protein of unknown function DUF736  57.14 
 
 		 107 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3021  hypothetical protein  57.14 
 
 		 107 aa  69.7  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3338  hypothetical protein  56.06 
 
 		 106 aa  69.3  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0185  hypothetical protein  55.22 
 
 		 183 aa  68.9  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.575618 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0764  hypothetical protein  55.38 
 
 		 108 aa  68.6  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2341  hypothetical protein  53.85 
 
 		 107 aa  68.6  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.201148  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2134  hypothetical protein  56.45 
 
 		 107 aa  67  0.00000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.909083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7724  hypothetical protein  49.38 
 
 		 169 aa  67  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0566039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1041  protein of unknown function DUF736  53.85 
 
 		 108 aa  66.2  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0683424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1484  hypothetical protein  53.73 
 
 		 107 aa  65.1  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5555  protein of unknown function DUF736  48.89 
 
 		 118 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.181543  normal  0.0176255 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2628  hypothetical protein  60.42 
 
 		 105 aa  53.9  0.0000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5532  protein of unknown function DUF736  55.26 
 
 		 105 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0325205 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6057  hypothetical protein  47.46 
 
 		 105 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2497  hypothetical protein  47.92 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.194565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0986  protein of unknown function DUF736  36.73 
 
 		 105 aa  40.4  0.008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00218304  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>