30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2291 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_2291    100 
 
 
478 bp  948    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5975    93.94 
 
 
895 bp  50.1  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.100438  normal  0.316362 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1266  transposase, IS4  90 
 
 
1023 bp  48.1  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2596  transposase, IS4  91.43 
 
 
1110 bp  46.1  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7153  transposase  91.43 
 
 
1110 bp  46.1  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6919  transposase  91.43 
 
 
1110 bp  46.1  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.439237 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3911  transposase  91.43 
 
 
1110 bp  46.1  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.664589  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1814    91.43 
 
 
456 bp  46.1  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.628479  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3654  transposase, IS4  91.43 
 
 
1110 bp  46.1  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.258841  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3552  transposase, IS4  91.43 
 
 
1110 bp  46.1  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3440  transposase, IS4  91.43 
 
 
1110 bp  46.1  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0308754  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3414  transposase, IS4  91.43 
 
 
1110 bp  46.1  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3391  transposase, IS4  91.43 
 
 
1110 bp  46.1  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.401653  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3290  transposase, IS4  91.43 
 
 
1110 bp  46.1  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3140  transposase, IS4  91.43 
 
 
1110 bp  46.1  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3113  transposase, IS4  91.43 
 
 
1110 bp  46.1  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0014  transposase, IS4  91.43 
 
 
726 bp  46.1  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0462942  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2500  transposase, IS4  91.43 
 
 
726 bp  46.1  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2160  transposase, IS4  91.43 
 
 
1110 bp  46.1  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.591575  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1821  transposase, IS4  91.43 
 
 
1110 bp  46.1  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1692  transposase, IS4  91.43 
 
 
408 bp  46.1  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.263222  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1653  transposase, IS4  91.43 
 
 
1110 bp  46.1  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.891331  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1498  transposase, IS4  91.43 
 
 
1110 bp  46.1  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1473  transposase, IS4  91.43 
 
 
1110 bp  46.1  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.282239  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1380    91.43 
 
 
428 bp  46.1  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1135  transposase, IS4  91.43 
 
 
1110 bp  46.1  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.064838  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1095  transposase, IS4  91.43 
 
 
1110 bp  46.1  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0701  transposase, IS4  91.43 
 
 
1110 bp  46.1  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0512  transposase, IS4  91.43 
 
 
1110 bp  46.1  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.692808  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0246  transposase, IS4  91.43 
 
 
726 bp  46.1  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.261546  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>