25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_3520 on replicon NC_014213
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014213  Mesil_3520  hypothetical protein  100 
 
 
124 aa  253  6e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000363684 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0600  hypothetical protein  80.6 
 
 
118 aa  112  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0476447  normal  0.181324 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0601  hypothetical protein  79.25 
 
 
79 aa  85.9  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.259167  normal  0.179543 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0532  hypothetical protein  45.45 
 
 
117 aa  67.8  0.00000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.330489  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0533  hypothetical protein  50.94 
 
 
78 aa  57  0.00000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.38685  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2639  protein of unknown function DUF433  67.57 
 
 
69 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0907931  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1368  hypothetical protein  35.71 
 
 
117 aa  55.5  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2642  hypothetical protein  36.36 
 
 
117 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4513  protein of unknown function DUF433  65.85 
 
 
78 aa  54.3  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3854  protein of unknown function DUF433  51.06 
 
 
79 aa  54.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.949031 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0712  hypothetical protein  42.37 
 
 
77 aa  53.9  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.10879  normal  0.629706 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4512  hypothetical protein  36.36 
 
 
117 aa  53.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.90814 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0820  hypothetical protein  39.39 
 
 
110 aa  53.5  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0617234  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1312  hypothetical protein  65.71 
 
 
83 aa  52.4  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2643  hypothetical protein  39.13 
 
 
76 aa  52.4  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1367  hypothetical protein  42.37 
 
 
75 aa  51.6  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.883887  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4387  protein of unknown function DUF433  62.16 
 
 
73 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0716835 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5087  hypothetical protein  44.26 
 
 
118 aa  47.4  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000115983  normal  0.14262 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5088  protein of unknown function DUF433  33.33 
 
 
75 aa  46.2  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000523487  normal  0.135108 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0386  hypothetical protein  40.91 
 
 
79 aa  43.5  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3160  protein of unknown function DUF433  46.15 
 
 
82 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.419433  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6321  hypothetical protein  46.15 
 
 
79 aa  42  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2516  protein of unknown function DUF433  48.72 
 
 
82 aa  41.2  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0559942  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0429  protein of unknown function DUF433  58.33 
 
 
78 aa  41.2  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0082  hypothetical protein  55.88 
 
 
76 aa  41.2  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.024664 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>