21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_3083 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_3083  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
650 aa  1321    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.620429  normal  0.485634 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1633  hypothetical protein  45.62 
 
 
634 aa  523  1e-147  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00578112  normal  0.776269 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0365  hypothetical protein  42.77 
 
 
644 aa  465  9.999999999999999e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0591662  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16360  hypothetical protein  43.4 
 
 
620 aa  433  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1422  hypothetical protein  42.83 
 
 
620 aa  429  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3641  twin-arginine translocation pathway signal  40.9 
 
 
636 aa  419  1e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3728  hypothetical protein  40.79 
 
 
621 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.154928  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1077  hypothetical protein  36.7 
 
 
631 aa  402  9.999999999999999e-111  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.866744  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1600  twin-arginine translocation pathway signal  36.88 
 
 
610 aa  286  9e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.624014  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1454  twin-arginine translocation pathway signal  33.85 
 
 
612 aa  285  2.0000000000000002e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0574  FAD dependent oxidoreductase  30.89 
 
 
630 aa  217  7e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.186923  normal  0.385317 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4617  hypothetical protein  29.66 
 
 
650 aa  209  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.119323  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1075  FAD dependent oxidoreductase  30.36 
 
 
649 aa  201  3e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0882552 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3715  twin-arginine translocation pathway signal  25 
 
 
550 aa  52.4  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.697054  normal  0.0792167 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1565  FAD dependent oxidoreductase  44.68 
 
 
510 aa  49.7  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377781  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1542  putative monooxygenase  42.55 
 
 
502 aa  48.1  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.906051  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0853  flavin-binding family monooxygenase  44.19 
 
 
527 aa  46.6  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1123  FAD dependent oxidoreductase  51.22 
 
 
494 aa  46.6  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.176279  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1683  FAD dependent oxidoreductase  38.46 
 
 
513 aa  46.6  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1934  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 
472 aa  44.3  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0431251 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1568  twin-arginine translocation pathway signal  23.12 
 
 
536 aa  43.9  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>