34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2928 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_2928  transcription activator effector binding protein  100 
 
 		 185 aa  378  1e-104  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.314738 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2308  transcription activator effector binding protein  46.78 
 
 		 155 aa  139  1.9999999999999998e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.20456 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3397  transcription activator effector binding  27.37 
 
 		 154 aa  65.1  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000497279  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4749  transcription activator effector binding  26.46 
 
 		 158 aa  64.7  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5066  hypothetical protein  26.18 
 
 		 158 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4660  DNA-binding protein  25.53 
 
 		 158 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3688  transcription activator effector binding  29.61 
 
 		 153 aa  63.9  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5068  DNA-binding protein YobU  25.53 
 
 		 159 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4799  hypothetical protein  24.47 
 
 		 159 aa  62.4  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5039  hypothetical protein  24.47 
 
 		 159 aa  62.4  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5162  hypothetical protein  24.47 
 
 		 159 aa  62.4  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4641  DNA-binding protein  25.65 
 
 		 159 aa  62.8  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5072  hypothetical protein  24.47 
 
 		 158 aa  61.6  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0189  transcription activator effector binding  29.35 
 
 		 156 aa  60.5  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.4925  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0171  transcription activator, effector binding  29.35 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.486669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0175  hypothetical protein  24.47 
 
 		 158 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1824  transcription activator effector binding  28.49 
 
 		 155 aa  60.1  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.343494  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2436  transcription activator effector binding protein  25.42 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.236328  normal  0.052404 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0107  hypothetical protein  28.3 
 
 		 153 aa  57  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0580328  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2865  transcription activator effector binding  25.14 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.372254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7160  transcription activator effector binding protein  26.67 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.46886  normal  0.0205342 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2786  transcription activator, effector binding  29.41 
 
 		 146 aa  52.8  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1918  transcription activator effector binding  23.89 
 
 		 148 aa  51.6  0.000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00982966  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0560  hypothetical protein  23.43 
 
 		 177 aa  51.2  0.000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.754603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0283  CTA2 subfamily 1 protein  25.93 
 
 		 158 aa  50.4  0.00001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000189572  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0548  transcription activator, effector binding  22.29 
 
 		 174 aa  50.4  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.283386 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0763  transcription activator effector binding  28 
 
 		 146 aa  48.1  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000404433  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06778  hypothetical protein  24.58 
 
 		 149 aa  47.8  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0019  DNA-binding protein  24.16 
 
 		 164 aa  46.6  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2542  transcription activator, effector binding  27.43 
 
 		 152 aa  47  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1875  hypothetical protein  23.9 
 
 		 154 aa  43.5  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2199  transcription activator, effector binding  27.84 
 
 		 159 aa  42.4  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0711  transcription activator effector binding  22.6 
 
 		 155 aa  41.6  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3143  transcription activator effector binding  22.7 
 
 		 165 aa  41.2  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>