14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_R0011 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_R0011  tRNA-Ser  100 
 
 		 87 bp  172  9e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0176232  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0069  tRNA-Ser  94.25 
 
 		 86 bp  125  2e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.980326  normal  0.628883 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0001  tRNA-Ser  90.8 
 
 		 84 bp  95.6  2e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00371061 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0003  tRNA-Ser  87.69 
 
 		 83 bp  60  0.00000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.503711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0001  tRNA-Ser  89.23 
 
 		 83 bp  58  0.0000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.108923  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0009  tRNA-Ser  91.49 
 
 		 84 bp  56  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0068  tRNA-Ser  86.25 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.802658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0040  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.412277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0026  tRNA-Ser  100 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0024  tRNA-Ser  100 
 
 		 84 bp  50.1  0.00009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.1252  hitchhiker  0.00000142031 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0002  tRNA-Ser  100 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.302196  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0053  tRNA-Ser  100 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.35956 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0051  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00598275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0020  tRNA-Ser  100 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.255159  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>