20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1966 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1966  prefoldin, alpha subunit  100 
 
 
149 aa  290  3e-78  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0542  prefoldin, alpha subunit  55.8 
 
 
156 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000518948  normal  0.901506 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3021  prefoldin alpha subunit  43.36 
 
 
149 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1879  prefoldin, alpha subunit  55.97 
 
 
180 aa  125  2.0000000000000002e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0986301 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1477  hypothetical protein  41.18 
 
 
147 aa  99.4  1e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000022612  hitchhiker  0.000493368 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0395  prefoldin subunit alpha  43.48 
 
 
145 aa  70.5  0.000000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0549936 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1364  prefoldin subunit alpha  29.55 
 
 
144 aa  68.9  0.00000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0780  prefoldin subunit alpha  26.21 
 
 
146 aa  65.9  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.428943  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0238  prefoldin, alpha subunit  40.91 
 
 
149 aa  58.9  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0111  prefoldin subunit alpha  31.58 
 
 
138 aa  58.2  0.00000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.162217  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0715  prefoldin subunit alpha  24.82 
 
 
144 aa  55.5  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.347569 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1203  prefoldin subunit alpha  25.55 
 
 
144 aa  55.1  0.0000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.14629  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0108  prefoldin subunit alpha  26.28 
 
 
144 aa  55.1  0.0000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0756158  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1816  prefoldin, alpha subunit  35 
 
 
150 aa  46.6  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1230  prefoldin, alpha subunit  38.96 
 
 
152 aa  45.1  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.720721 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0461  prefoldin subunit alpha  25.56 
 
 
144 aa  44.3  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.735379  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1329  prefoldin, alpha subunit  39.66 
 
 
155 aa  44.3  0.0006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0822  prefoldin, alpha subunit  29.35 
 
 
152 aa  43.9  0.0007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.777251  normal  0.974063 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0430  prefoldin, alpha subunit  28.89 
 
 
129 aa  43.9  0.0008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0871  prefoldin, alpha subunit  24.43 
 
 
157 aa  42.4  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>