18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_5482 on replicon NC_011758
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011758  Mchl_5482    100 
 
 		 267 bp  529  1e-148  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.688007 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0927  transposase IS3/IS911 family protein  84.16 
 
 		 228 bp  73.8  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4090  transposase IS3/IS911 family protein  84.16 
 
 		 267 bp  73.8  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.702583  normal  0.16367 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3356  insertion element ISR1 uncharacterized 10 kDa protein A3  84.16 
 
 		 267 bp  73.8  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2510  transposase  84.16 
 
 		 267 bp  73.8  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.021123 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0403  insertion element ISR1 uncharacterized 10 kDa protein A3  84.16 
 
 		 267 bp  73.8  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.868889 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2967  transposase IS3/IS911  91.49 
 
 		 288 bp  61.9  0.00000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.142788 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4335  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 267 bp  50.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.983933  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4528  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 267 bp  50.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1957    86.79 
 
 		 75 bp  50.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2861  transposase IS3/IS911 family protein  82.14 
 
 		 267 bp  48.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6507  transposase IS3/IS911 family protein  82.14 
 
 		 267 bp  48.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6241  transposase IS3/IS911 family protein  82.14 
 
 		 267 bp  48.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.328617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5715  transposase IS3/IS911 family protein  82.14 
 
 		 267 bp  48.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1262  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  96.43 
 
 		 1320 bp  48.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.99333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5713    82.14 
 
 		 1992 bp  48.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5637    100 
 
 		 1121 bp  46.1  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.372072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5642    100 
 
 		 1121 bp  46.1  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.330128  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>